Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZK1

Cep44, Centrosomal protein of 44 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep44Q5HZK1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep44Q5HZK1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep44Q5HZK1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep44Q5HZK1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cep44Q5HZK1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep44Q5HZK1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep44Q5HZK1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep44Q5HZK1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep44Q5HZK1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep44Q5HZK1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep44Q5HZK1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep44Q5HZK1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep44Q5HZK1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep44Q5HZK1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep44Q5HZK1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep44Q5HZK1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep44Q5HZK1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep44Q5HZK1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep44Q5HZK1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep44Q5HZK1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep44Q5HZK1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep44Q5HZK1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep44Q5HZK1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep44Q5HZK1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep44Q5HZK1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cep44Q5HZK1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cep44Q5HZK1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cep44Q5HZK1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep44Q5HZK1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep44Q5HZK1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep44Q5HZK1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep44Q5HZK1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep44Q5HZK1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cep44Q5HZK1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cep44Q5HZK1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cep44Q5HZK1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cep44Q5HZK1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cep44Q5HZK1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cep44Q5HZK1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cep44Q5HZK1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cep44Q5HZK1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cep44Q5HZK1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cep44Q5HZK1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cep44Q5HZK1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cep44Q5HZK1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cep44Q5HZK1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cep44Q5HZK1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cep44Q5HZK1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cep44Q5HZK1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cep44Q5HZK1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cep44Q5HZK1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cep44Q5HZK1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cep44Q5HZK1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cep44Q5HZK1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cep44Q5HZK1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cep44Q5HZK1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cep44Q5HZK1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cep44Q5HZK1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cep44Q5HZK1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cep44Q5HZK1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cep44Q5HZK1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cep44Q5HZK1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cep44Q5HZK1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cep44Q5HZK1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cep44Q5HZK1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cep44Q5HZK1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cep44Q5HZK1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cep44Q5HZK1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cep44Q5HZK1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cep44Q5HZK1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cep44Q5HZK1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cep44Q5HZK1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cep44Q5HZK1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cep44Q5HZK1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cep44Q5HZK1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cep44Q5HZK1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cep44Q5HZK1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cep44Q5HZK1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cep44Q5HZK1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cep44Q5HZK1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep44Q5HZK1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep44Q5HZK1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep44Q5HZK1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep44Q5HZK1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep44Q5HZK1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cep44Q5HZK1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cep44Q5HZK1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cep44Q5HZK1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cep44Q5HZK1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cep44Q5HZK1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cep44Q5HZK1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cep44Q5HZK1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cep44Q5HZK1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cep44Q5HZK1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cep44Q5HZK1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cep44Q5HZK1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cep44Q5HZK1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cep44Q5HZK1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cep44Q5HZK1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cep44Q5HZK1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms