Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sfmbt2Q5DTW2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sfmbt2Q5DTW2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sfmbt2Q5DTW2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sfmbt2Q5DTW2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sfmbt2Q5DTW2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sfmbt2Q5DTW2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sfmbt2Q5DTW2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sfmbt2Q5DTW2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sfmbt2Q5DTW2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sfmbt2Q5DTW2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sfmbt2Q5DTW2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sfmbt2Q5DTW2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sfmbt2Q5DTW2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sfmbt2Q5DTW2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sfmbt2Q5DTW2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sfmbt2Q5DTW2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sfmbt2Q5DTW2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sfmbt2Q5DTW2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sfmbt2Q5DTW2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sfmbt2Q5DTW2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sfmbt2Q5DTW2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sfmbt2Q5DTW2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sfmbt2Q5DTW2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sfmbt2Q5DTW2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sfmbt2Q5DTW2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sfmbt2Q5DTW2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sfmbt2Q5DTW2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sfmbt2Q5DTW2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sfmbt2Q5DTW2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sfmbt2Q5DTW2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sfmbt2Q5DTW2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sfmbt2Q5DTW2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sfmbt2Q5DTW2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sfmbt2Q5DTW2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sfmbt2Q5DTW2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sfmbt2Q5DTW2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sfmbt2Q5DTW2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sfmbt2Q5DTW2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sfmbt2Q5DTW2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sfmbt2Q5DTW2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sfmbt2Q5DTW2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sfmbt2Q5DTW2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sfmbt2Q5DTW2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sfmbt2Q5DTW2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sfmbt2Q5DTW2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sfmbt2Q5DTW2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sfmbt2Q5DTW2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sfmbt2Q5DTW2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sfmbt2Q5DTW2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sfmbt2Q5DTW2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sfmbt2Q5DTW2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sfmbt2Q5DTW2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sfmbt2Q5DTW2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sfmbt2Q5DTW2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sfmbt2Q5DTW2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sfmbt2Q5DTW2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sfmbt2Q5DTW2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sfmbt2Q5DTW2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sfmbt2Q5DTW2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sfmbt2Q5DTW2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sfmbt2Q5DTW2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sfmbt2Q5DTW2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sfmbt2Q5DTW2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sfmbt2Q5DTW2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sfmbt2Q5DTW2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sfmbt2Q5DTW2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sfmbt2Q5DTW2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sfmbt2Q5DTW2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sfmbt2Q5DTW2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sfmbt2Q5DTW2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sfmbt2Q5DTW2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sfmbt2Q5DTW2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sfmbt2Q5DTW2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sfmbt2Q5DTW2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sfmbt2Q5DTW2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sfmbt2Q5DTW2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sfmbt2Q5DTW2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sfmbt2Q5DTW2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sfmbt2Q5DTW2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sfmbt2Q5DTW2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sfmbt2Q5DTW2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sfmbt2Q5DTW2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sfmbt2Q5DTW2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sfmbt2Q5DTW2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sfmbt2Q5DTW2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sfmbt2Q5DTW2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sfmbt2Q5DTW2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sfmbt2Q5DTW2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sfmbt2Q5DTW2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sfmbt2Q5DTW2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sfmbt2Q5DTW2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sfmbt2Q5DTW2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sfmbt2Q5DTW2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sfmbt2Q5DTW2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sfmbt2Q5DTW2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sfmbt2Q5DTW2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sfmbt2Q5DTW2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sfmbt2Q5DTW2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms