Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rtl5Q5DTT4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rtl5Q5DTT4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rtl5Q5DTT4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rtl5Q5DTT4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rtl5Q5DTT4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rtl5Q5DTT4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rtl5Q5DTT4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rtl5Q5DTT4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rtl5Q5DTT4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rtl5Q5DTT4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rtl5Q5DTT4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rtl5Q5DTT4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rtl5Q5DTT4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rtl5Q5DTT4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rtl5Q5DTT4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rtl5Q5DTT4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Rtl5Q5DTT4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Rtl5Q5DTT4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Rtl5Q5DTT4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Rtl5Q5DTT4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rtl5Q5DTT4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rtl5Q5DTT4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Rtl5Q5DTT4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Rtl5Q5DTT4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rtl5Q5DTT4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Rtl5Q5DTT4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Rtl5Q5DTT4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Rtl5Q5DTT4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rtl5Q5DTT4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rtl5Q5DTT4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rtl5Q5DTT4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rtl5Q5DTT4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rtl5Q5DTT4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rtl5Q5DTT4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Rtl5Q5DTT4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Rtl5Q5DTT4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Rtl5Q5DTT4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Rtl5Q5DTT4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rtl5Q5DTT4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rtl5Q5DTT4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Rtl5Q5DTT4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rtl5Q5DTT4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rtl5Q5DTT4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rtl5Q5DTT4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rtl5Q5DTT4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rtl5Q5DTT4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rtl5Q5DTT4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rtl5Q5DTT4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rtl5Q5DTT4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rtl5Q5DTT4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rtl5Q5DTT4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rtl5Q5DTT4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rtl5Q5DTT4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rtl5Q5DTT4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rtl5Q5DTT4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rtl5Q5DTT4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rtl5Q5DTT4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rtl5Q5DTT4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rtl5Q5DTT4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rtl5Q5DTT4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rtl5Q5DTT4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rtl5Q5DTT4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rtl5Q5DTT4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Rtl5Q5DTT4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rtl5Q5DTT4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rtl5Q5DTT4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rtl5Q5DTT4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rtl5Q5DTT4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rtl5Q5DTT4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rtl5Q5DTT4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rtl5Q5DTT4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rtl5Q5DTT4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Rtl5Q5DTT4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rtl5Q5DTT4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rtl5Q5DTT4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rtl5Q5DTT4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rtl5Q5DTT4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rtl5Q5DTT4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rtl5Q5DTT4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Rtl5Q5DTT4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rtl5Q5DTT4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rtl5Q5DTT4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rtl5Q5DTT4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rtl5Q5DTT4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rtl5Q5DTT4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rtl5Q5DTT4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rtl5Q5DTT4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rtl5Q5DTT4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rtl5Q5DTT4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rtl5Q5DTT4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rtl5Q5DTT4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rtl5Q5DTT4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rtl5Q5DTT4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rtl5Q5DTT4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Rtl5Q5DTT4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rtl5Q5DTT4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rtl5Q5DTT4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rtl5Q5DTT4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rtl5Q5DTT4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms