Protein–RNA interactions for Protein: Q501J7

Phactr4, Phosphatase and actin regulator 4, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr4Q501J7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Phactr4Q501J7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Phactr4Q501J7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Phactr4Q501J7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Phactr4Q501J7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Phactr4Q501J7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Phactr4Q501J7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Phactr4Q501J7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Phactr4Q501J7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Phactr4Q501J7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Phactr4Q501J7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Phactr4Q501J7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Phactr4Q501J7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Phactr4Q501J7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Phactr4Q501J7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Phactr4Q501J7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Phactr4Q501J7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Phactr4Q501J7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Phactr4Q501J7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Phactr4Q501J7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Phactr4Q501J7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Phactr4Q501J7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Phactr4Q501J7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Phactr4Q501J7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Phactr4Q501J7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Phactr4Q501J7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Phactr4Q501J7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Phactr4Q501J7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Phactr4Q501J7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Phactr4Q501J7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Phactr4Q501J7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Phactr4Q501J7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Phactr4Q501J7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Phactr4Q501J7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Phactr4Q501J7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Phactr4Q501J7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Phactr4Q501J7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Phactr4Q501J7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Phactr4Q501J7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Phactr4Q501J7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Phactr4Q501J7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Phactr4Q501J7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Phactr4Q501J7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phactr4Q501J7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phactr4Q501J7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phactr4Q501J7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Phactr4Q501J7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Phactr4Q501J7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Phactr4Q501J7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Phactr4Q501J7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Phactr4Q501J7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Phactr4Q501J7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Phactr4Q501J7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Phactr4Q501J7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Phactr4Q501J7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Phactr4Q501J7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Phactr4Q501J7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Phactr4Q501J7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Phactr4Q501J7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Phactr4Q501J7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Phactr4Q501J7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Phactr4Q501J7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Phactr4Q501J7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Phactr4Q501J7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Phactr4Q501J7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Phactr4Q501J7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Phactr4Q501J7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Phactr4Q501J7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Phactr4Q501J7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Phactr4Q501J7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Phactr4Q501J7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Phactr4Q501J7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Phactr4Q501J7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Phactr4Q501J7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Phactr4Q501J7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Phactr4Q501J7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Phactr4Q501J7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Phactr4Q501J7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Phactr4Q501J7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Phactr4Q501J7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Phactr4Q501J7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Phactr4Q501J7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Phactr4Q501J7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Phactr4Q501J7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Phactr4Q501J7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Phactr4Q501J7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Phactr4Q501J7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Phactr4Q501J7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Phactr4Q501J7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Phactr4Q501J7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Phactr4Q501J7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Phactr4Q501J7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Phactr4Q501J7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Phactr4Q501J7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Phactr4Q501J7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Phactr4Q501J7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Phactr4Q501J7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Phactr4Q501J7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Phactr4Q501J7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Phactr4Q501J7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.3 ms