Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA53

Pds5b, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5bQ4VA53 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC44.25■■■■■ 4.67
Pds5bQ4VA53 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC44.21■■■■■ 4.67
Pds5bQ4VA53 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
Pds5bQ4VA53 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
Pds5bQ4VA53 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
Pds5bQ4VA53 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
Pds5bQ4VA53 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
Pds5bQ4VA53 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC44.16■■■■■ 4.66
Pds5bQ4VA53 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
Pds5bQ4VA53 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
Pds5bQ4VA53 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
Pds5bQ4VA53 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC44.12■■■■■ 4.65
Pds5bQ4VA53 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
Pds5bQ4VA53 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC44.11■■■■■ 4.65
Pds5bQ4VA53 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.11■■■■■ 4.65
Pds5bQ4VA53 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
Pds5bQ4VA53 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC44.1■■■■■ 4.65
Pds5bQ4VA53 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC44.1■■■■■ 4.65
Pds5bQ4VA53 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
Pds5bQ4VA53 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
Pds5bQ4VA53 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
Pds5bQ4VA53 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
Pds5bQ4VA53 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
Pds5bQ4VA53 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
Pds5bQ4VA53 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.64
Pds5bQ4VA53 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.64
Pds5bQ4VA53 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.64
Pds5bQ4VA53 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
Pds5bQ4VA53 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
Pds5bQ4VA53 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
Pds5bQ4VA53 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
Pds5bQ4VA53 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC44.02■■■■■ 4.64
Pds5bQ4VA53 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Pds5bQ4VA53 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.01■■■■■ 4.64
Pds5bQ4VA53 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC44■■■■■ 4.63
Pds5bQ4VA53 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
Pds5bQ4VA53 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
Pds5bQ4VA53 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC43.98■■■■■ 4.63
Pds5bQ4VA53 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
Pds5bQ4VA53 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC43.98■■■■■ 4.63
Pds5bQ4VA53 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
Pds5bQ4VA53 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
Pds5bQ4VA53 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC43.97■■■■■ 4.63
Pds5bQ4VA53 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC43.97■■■■■ 4.63
Pds5bQ4VA53 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC43.96■■■■■ 4.63
Pds5bQ4VA53 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
Pds5bQ4VA53 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.63
Pds5bQ4VA53 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC43.94■■■■■ 4.62
Pds5bQ4VA53 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC43.94■■■■■ 4.62
Pds5bQ4VA53 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
Pds5bQ4VA53 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.92■■■■■ 4.62
Pds5bQ4VA53 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
Pds5bQ4VA53 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
Pds5bQ4VA53 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC43.89■■■■■ 4.62
Pds5bQ4VA53 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC43.88■■■■■ 4.61
Pds5bQ4VA53 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
Pds5bQ4VA53 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
Pds5bQ4VA53 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
Pds5bQ4VA53 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.85■■■■■ 4.61
Pds5bQ4VA53 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC43.84■■■■■ 4.61
Pds5bQ4VA53 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
Pds5bQ4VA53 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
Pds5bQ4VA53 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
Pds5bQ4VA53 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.6
Pds5bQ4VA53 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
Pds5bQ4VA53 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
Pds5bQ4VA53 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
Pds5bQ4VA53 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
Pds5bQ4VA53 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
Pds5bQ4VA53 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
Pds5bQ4VA53 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
Pds5bQ4VA53 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
Pds5bQ4VA53 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
Pds5bQ4VA53 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
Pds5bQ4VA53 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
Pds5bQ4VA53 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.59
Pds5bQ4VA53 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC43.69■■■■■ 4.58
Pds5bQ4VA53 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC43.69■■■■■ 4.58
Pds5bQ4VA53 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
Pds5bQ4VA53 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.66■■■■■ 4.58
Pds5bQ4VA53 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
Pds5bQ4VA53 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
Pds5bQ4VA53 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
Pds5bQ4VA53 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.64■■■■■ 4.58
Pds5bQ4VA53 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
Pds5bQ4VA53 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
Pds5bQ4VA53 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.61■■■■■ 4.57
Pds5bQ4VA53 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC43.61■■■■■ 4.57
Pds5bQ4VA53 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC43.61■■■■■ 4.57
Pds5bQ4VA53 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC43.61■■■■■ 4.57
Pds5bQ4VA53 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC43.6■■■■■ 4.57
Pds5bQ4VA53 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
Pds5bQ4VA53 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
Pds5bQ4VA53 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC43.58■■■■■ 4.57
Pds5bQ4VA53 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
Pds5bQ4VA53 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
Pds5bQ4VA53 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
Pds5bQ4VA53 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
Pds5bQ4VA53 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
Pds5bQ4VA53 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms