Protein–RNA interactions for Protein: Q4KUS1

Wfdc8, WAP four-disulfide core domain protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wfdc8Q4KUS1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Wfdc8Q4KUS1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Wfdc8Q4KUS1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Wfdc8Q4KUS1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Wfdc8Q4KUS1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Wfdc8Q4KUS1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Wfdc8Q4KUS1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Wfdc8Q4KUS1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Wfdc8Q4KUS1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Wfdc8Q4KUS1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Wfdc8Q4KUS1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Wfdc8Q4KUS1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Wfdc8Q4KUS1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Wfdc8Q4KUS1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Wfdc8Q4KUS1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Wfdc8Q4KUS1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Wfdc8Q4KUS1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Wfdc8Q4KUS1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Wfdc8Q4KUS1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Wfdc8Q4KUS1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Wfdc8Q4KUS1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Wfdc8Q4KUS1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Wfdc8Q4KUS1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Wfdc8Q4KUS1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Wfdc8Q4KUS1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Wfdc8Q4KUS1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Wfdc8Q4KUS1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Wfdc8Q4KUS1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Wfdc8Q4KUS1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Wfdc8Q4KUS1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Wfdc8Q4KUS1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Wfdc8Q4KUS1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Wfdc8Q4KUS1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Wfdc8Q4KUS1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Wfdc8Q4KUS1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Wfdc8Q4KUS1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Wfdc8Q4KUS1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Wfdc8Q4KUS1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Wfdc8Q4KUS1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Wfdc8Q4KUS1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Wfdc8Q4KUS1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Wfdc8Q4KUS1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Wfdc8Q4KUS1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Wfdc8Q4KUS1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Wfdc8Q4KUS1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Wfdc8Q4KUS1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Wfdc8Q4KUS1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Wfdc8Q4KUS1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Wfdc8Q4KUS1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Wfdc8Q4KUS1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Wfdc8Q4KUS1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Wfdc8Q4KUS1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Wfdc8Q4KUS1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Wfdc8Q4KUS1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Wfdc8Q4KUS1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Wfdc8Q4KUS1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Wfdc8Q4KUS1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Wfdc8Q4KUS1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Wfdc8Q4KUS1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Wfdc8Q4KUS1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Wfdc8Q4KUS1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Wfdc8Q4KUS1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Wfdc8Q4KUS1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Wfdc8Q4KUS1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Wfdc8Q4KUS1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Wfdc8Q4KUS1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Wfdc8Q4KUS1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Wfdc8Q4KUS1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Wfdc8Q4KUS1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Wfdc8Q4KUS1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Wfdc8Q4KUS1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Wfdc8Q4KUS1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Wfdc8Q4KUS1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Wfdc8Q4KUS1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Wfdc8Q4KUS1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wfdc8Q4KUS1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wfdc8Q4KUS1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wfdc8Q4KUS1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Wfdc8Q4KUS1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Wfdc8Q4KUS1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Wfdc8Q4KUS1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Wfdc8Q4KUS1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Wfdc8Q4KUS1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Wfdc8Q4KUS1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wfdc8Q4KUS1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wfdc8Q4KUS1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wfdc8Q4KUS1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wfdc8Q4KUS1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wfdc8Q4KUS1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Wfdc8Q4KUS1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Wfdc8Q4KUS1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Wfdc8Q4KUS1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Wfdc8Q4KUS1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Wfdc8Q4KUS1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Wfdc8Q4KUS1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Wfdc8Q4KUS1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Wfdc8Q4KUS1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Wfdc8Q4KUS1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Wfdc8Q4KUS1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Wfdc8Q4KUS1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms