Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trappc3lQ4KL14 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trappc3lQ4KL14 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trappc3lQ4KL14 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trappc3lQ4KL14 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trappc3lQ4KL14 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trappc3lQ4KL14 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trappc3lQ4KL14 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trappc3lQ4KL14 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trappc3lQ4KL14 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trappc3lQ4KL14 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trappc3lQ4KL14 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trappc3lQ4KL14 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trappc3lQ4KL14 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trappc3lQ4KL14 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trappc3lQ4KL14 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trappc3lQ4KL14 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trappc3lQ4KL14 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trappc3lQ4KL14 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trappc3lQ4KL14 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trappc3lQ4KL14 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trappc3lQ4KL14 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trappc3lQ4KL14 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trappc3lQ4KL14 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trappc3lQ4KL14 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trappc3lQ4KL14 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Trappc3lQ4KL14 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trappc3lQ4KL14 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trappc3lQ4KL14 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trappc3lQ4KL14 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Trappc3lQ4KL14 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trappc3lQ4KL14 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Trappc3lQ4KL14 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trappc3lQ4KL14 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trappc3lQ4KL14 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trappc3lQ4KL14 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trappc3lQ4KL14 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trappc3lQ4KL14 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trappc3lQ4KL14 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trappc3lQ4KL14 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trappc3lQ4KL14 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trappc3lQ4KL14 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trappc3lQ4KL14 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trappc3lQ4KL14 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Trappc3lQ4KL14 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trappc3lQ4KL14 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Trappc3lQ4KL14 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trappc3lQ4KL14 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trappc3lQ4KL14 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Trappc3lQ4KL14 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trappc3lQ4KL14 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trappc3lQ4KL14 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trappc3lQ4KL14 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trappc3lQ4KL14 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trappc3lQ4KL14 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trappc3lQ4KL14 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Trappc3lQ4KL14 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trappc3lQ4KL14 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trappc3lQ4KL14 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Trappc3lQ4KL14 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trappc3lQ4KL14 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trappc3lQ4KL14 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Trappc3lQ4KL14 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trappc3lQ4KL14 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trappc3lQ4KL14 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trappc3lQ4KL14 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trappc3lQ4KL14 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trappc3lQ4KL14 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trappc3lQ4KL14 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trappc3lQ4KL14 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trappc3lQ4KL14 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trappc3lQ4KL14 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trappc3lQ4KL14 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Trappc3lQ4KL14 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trappc3lQ4KL14 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trappc3lQ4KL14 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trappc3lQ4KL14 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trappc3lQ4KL14 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trappc3lQ4KL14 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trappc3lQ4KL14 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trappc3lQ4KL14 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trappc3lQ4KL14 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trappc3lQ4KL14 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trappc3lQ4KL14 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trappc3lQ4KL14 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trappc3lQ4KL14 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trappc3lQ4KL14 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trappc3lQ4KL14 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Trappc3lQ4KL14 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trappc3lQ4KL14 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trappc3lQ4KL14 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trappc3lQ4KL14 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trappc3lQ4KL14 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trappc3lQ4KL14 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trappc3lQ4KL14 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trappc3lQ4KL14 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trappc3lQ4KL14 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trappc3lQ4KL14 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms