Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syne3Q4FZC9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syne3Q4FZC9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syne3Q4FZC9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syne3Q4FZC9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syne3Q4FZC9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syne3Q4FZC9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syne3Q4FZC9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syne3Q4FZC9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syne3Q4FZC9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syne3Q4FZC9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syne3Q4FZC9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Syne3Q4FZC9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Syne3Q4FZC9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Syne3Q4FZC9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Syne3Q4FZC9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Syne3Q4FZC9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syne3Q4FZC9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syne3Q4FZC9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syne3Q4FZC9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syne3Q4FZC9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syne3Q4FZC9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syne3Q4FZC9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syne3Q4FZC9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syne3Q4FZC9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syne3Q4FZC9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syne3Q4FZC9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syne3Q4FZC9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syne3Q4FZC9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syne3Q4FZC9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Syne3Q4FZC9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Syne3Q4FZC9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Syne3Q4FZC9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syne3Q4FZC9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syne3Q4FZC9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syne3Q4FZC9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syne3Q4FZC9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syne3Q4FZC9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syne3Q4FZC9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syne3Q4FZC9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syne3Q4FZC9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syne3Q4FZC9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syne3Q4FZC9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syne3Q4FZC9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syne3Q4FZC9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syne3Q4FZC9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syne3Q4FZC9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syne3Q4FZC9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syne3Q4FZC9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syne3Q4FZC9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syne3Q4FZC9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syne3Q4FZC9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syne3Q4FZC9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syne3Q4FZC9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Syne3Q4FZC9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Syne3Q4FZC9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Syne3Q4FZC9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Syne3Q4FZC9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Syne3Q4FZC9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syne3Q4FZC9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syne3Q4FZC9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syne3Q4FZC9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syne3Q4FZC9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Syne3Q4FZC9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syne3Q4FZC9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syne3Q4FZC9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Syne3Q4FZC9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syne3Q4FZC9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syne3Q4FZC9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syne3Q4FZC9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syne3Q4FZC9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syne3Q4FZC9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syne3Q4FZC9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syne3Q4FZC9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syne3Q4FZC9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syne3Q4FZC9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syne3Q4FZC9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syne3Q4FZC9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syne3Q4FZC9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syne3Q4FZC9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syne3Q4FZC9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syne3Q4FZC9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Syne3Q4FZC9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syne3Q4FZC9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Syne3Q4FZC9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Syne3Q4FZC9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syne3Q4FZC9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syne3Q4FZC9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syne3Q4FZC9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syne3Q4FZC9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Syne3Q4FZC9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Syne3Q4FZC9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Syne3Q4FZC9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Syne3Q4FZC9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Syne3Q4FZC9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Syne3Q4FZC9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Syne3Q4FZC9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Syne3Q4FZC9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syne3Q4FZC9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syne3Q4FZC9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms