Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim26Q3V460 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim26Q3V460 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim26Q3V460 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim26Q3V460 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim26Q3V460 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim26Q3V460 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim26Q3V460 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim26Q3V460 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim26Q3V460 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim26Q3V460 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim26Q3V460 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim26Q3V460 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim26Q3V460 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim26Q3V460 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim26Q3V460 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim26Q3V460 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim26Q3V460 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim26Q3V460 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim26Q3V460 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim26Q3V460 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim26Q3V460 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim26Q3V460 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim26Q3V460 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim26Q3V460 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim26Q3V460 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim26Q3V460 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim26Q3V460 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim26Q3V460 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim26Q3V460 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim26Q3V460 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim26Q3V460 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim26Q3V460 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim26Q3V460 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim26Q3V460 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim26Q3V460 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim26Q3V460 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim26Q3V460 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim26Q3V460 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim26Q3V460 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim26Q3V460 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim26Q3V460 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim26Q3V460 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim26Q3V460 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim26Q3V460 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim26Q3V460 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim26Q3V460 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim26Q3V460 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim26Q3V460 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim26Q3V460 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim26Q3V460 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim26Q3V460 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim26Q3V460 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim26Q3V460 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim26Q3V460 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim26Q3V460 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim26Q3V460 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim26Q3V460 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim26Q3V460 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim26Q3V460 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim26Q3V460 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim26Q3V460 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim26Q3V460 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim26Q3V460 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim26Q3V460 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim26Q3V460 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim26Q3V460 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim26Q3V460 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim26Q3V460 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim26Q3V460 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim26Q3V460 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smim26Q3V460 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim26Q3V460 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim26Q3V460 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim26Q3V460 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim26Q3V460 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim26Q3V460 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim26Q3V460 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim26Q3V460 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim26Q3V460 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim26Q3V460 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim26Q3V460 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim26Q3V460 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim26Q3V460 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim26Q3V460 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim26Q3V460 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim26Q3V460 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim26Q3V460 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim26Q3V460 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim26Q3V460 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim26Q3V460 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim26Q3V460 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim26Q3V460 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim26Q3V460 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim26Q3V460 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim26Q3V460 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim26Q3V460 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim26Q3V460 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim26Q3V460 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim26Q3V460 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms