Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pydc3Q3V3Q4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pydc3Q3V3Q4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pydc3Q3V3Q4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pydc3Q3V3Q4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pydc3Q3V3Q4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pydc3Q3V3Q4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pydc3Q3V3Q4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pydc3Q3V3Q4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pydc3Q3V3Q4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pydc3Q3V3Q4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pydc3Q3V3Q4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pydc3Q3V3Q4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pydc3Q3V3Q4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pydc3Q3V3Q4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pydc3Q3V3Q4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pydc3Q3V3Q4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pydc3Q3V3Q4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pydc3Q3V3Q4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pydc3Q3V3Q4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pydc3Q3V3Q4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pydc3Q3V3Q4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pydc3Q3V3Q4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pydc3Q3V3Q4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pydc3Q3V3Q4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pydc3Q3V3Q4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pydc3Q3V3Q4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pydc3Q3V3Q4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pydc3Q3V3Q4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pydc3Q3V3Q4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pydc3Q3V3Q4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pydc3Q3V3Q4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pydc3Q3V3Q4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pydc3Q3V3Q4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pydc3Q3V3Q4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pydc3Q3V3Q4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pydc3Q3V3Q4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pydc3Q3V3Q4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pydc3Q3V3Q4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pydc3Q3V3Q4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pydc3Q3V3Q4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pydc3Q3V3Q4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pydc3Q3V3Q4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pydc3Q3V3Q4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pydc3Q3V3Q4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pydc3Q3V3Q4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pydc3Q3V3Q4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pydc3Q3V3Q4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pydc3Q3V3Q4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pydc3Q3V3Q4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pydc3Q3V3Q4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pydc3Q3V3Q4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pydc3Q3V3Q4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pydc3Q3V3Q4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pydc3Q3V3Q4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pydc3Q3V3Q4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pydc3Q3V3Q4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pydc3Q3V3Q4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pydc3Q3V3Q4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pydc3Q3V3Q4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pydc3Q3V3Q4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pydc3Q3V3Q4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pydc3Q3V3Q4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pydc3Q3V3Q4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pydc3Q3V3Q4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pydc3Q3V3Q4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pydc3Q3V3Q4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pydc3Q3V3Q4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pydc3Q3V3Q4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pydc3Q3V3Q4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pydc3Q3V3Q4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pydc3Q3V3Q4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pydc3Q3V3Q4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pydc3Q3V3Q4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pydc3Q3V3Q4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pydc3Q3V3Q4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pydc3Q3V3Q4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pydc3Q3V3Q4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pydc3Q3V3Q4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pydc3Q3V3Q4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pydc3Q3V3Q4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pydc3Q3V3Q4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pydc3Q3V3Q4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pydc3Q3V3Q4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pydc3Q3V3Q4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pydc3Q3V3Q4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pydc3Q3V3Q4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pydc3Q3V3Q4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pydc3Q3V3Q4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pydc3Q3V3Q4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pydc3Q3V3Q4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pydc3Q3V3Q4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pydc3Q3V3Q4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pydc3Q3V3Q4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pydc3Q3V3Q4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pydc3Q3V3Q4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pydc3Q3V3Q4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pydc3Q3V3Q4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pydc3Q3V3Q4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms