Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmub2Q3V209 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmub2Q3V209 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmub2Q3V209 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmub2Q3V209 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmub2Q3V209 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmub2Q3V209 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmub2Q3V209 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmub2Q3V209 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmub2Q3V209 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmub2Q3V209 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmub2Q3V209 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmub2Q3V209 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmub2Q3V209 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmub2Q3V209 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmub2Q3V209 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmub2Q3V209 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmub2Q3V209 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmub2Q3V209 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmub2Q3V209 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmub2Q3V209 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmub2Q3V209 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmub2Q3V209 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmub2Q3V209 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmub2Q3V209 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmub2Q3V209 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmub2Q3V209 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmub2Q3V209 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmub2Q3V209 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmub2Q3V209 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmub2Q3V209 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmub2Q3V209 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmub2Q3V209 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmub2Q3V209 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmub2Q3V209 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmub2Q3V209 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmub2Q3V209 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmub2Q3V209 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmub2Q3V209 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmub2Q3V209 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmub2Q3V209 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmub2Q3V209 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmub2Q3V209 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmub2Q3V209 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmub2Q3V209 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmub2Q3V209 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmub2Q3V209 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmub2Q3V209 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmub2Q3V209 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmub2Q3V209 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmub2Q3V209 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmub2Q3V209 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmub2Q3V209 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmub2Q3V209 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmub2Q3V209 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmub2Q3V209 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmub2Q3V209 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmub2Q3V209 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmub2Q3V209 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmub2Q3V209 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmub2Q3V209 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmub2Q3V209 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmub2Q3V209 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmub2Q3V209 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmub2Q3V209 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmub2Q3V209 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmub2Q3V209 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmub2Q3V209 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmub2Q3V209 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmub2Q3V209 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmub2Q3V209 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmub2Q3V209 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmub2Q3V209 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmub2Q3V209 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmub2Q3V209 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmub2Q3V209 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmub2Q3V209 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmub2Q3V209 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmub2Q3V209 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmub2Q3V209 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmub2Q3V209 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmub2Q3V209 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmub2Q3V209 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmub2Q3V209 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmub2Q3V209 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmub2Q3V209 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tmub2Q3V209 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmub2Q3V209 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmub2Q3V209 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmub2Q3V209 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmub2Q3V209 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmub2Q3V209 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmub2Q3V209 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmub2Q3V209 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmub2Q3V209 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmub2Q3V209 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmub2Q3V209 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmub2Q3V209 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmub2Q3V209 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmub2Q3V209 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms