Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930596D02RikQ3V0H9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930596D02RikQ3V0H9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930596D02RikQ3V0H9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930596D02RikQ3V0H9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930596D02RikQ3V0H9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930596D02RikQ3V0H9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930596D02RikQ3V0H9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930596D02RikQ3V0H9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930596D02RikQ3V0H9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930596D02RikQ3V0H9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930596D02RikQ3V0H9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930596D02RikQ3V0H9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930596D02RikQ3V0H9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930596D02RikQ3V0H9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930596D02RikQ3V0H9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930596D02RikQ3V0H9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930596D02RikQ3V0H9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930596D02RikQ3V0H9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930596D02RikQ3V0H9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930596D02RikQ3V0H9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930596D02RikQ3V0H9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930596D02RikQ3V0H9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930596D02RikQ3V0H9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930596D02RikQ3V0H9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930596D02RikQ3V0H9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930596D02RikQ3V0H9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930596D02RikQ3V0H9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930596D02RikQ3V0H9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
4930596D02RikQ3V0H9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930596D02RikQ3V0H9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930596D02RikQ3V0H9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930596D02RikQ3V0H9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930596D02RikQ3V0H9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930596D02RikQ3V0H9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930596D02RikQ3V0H9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930596D02RikQ3V0H9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930596D02RikQ3V0H9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930596D02RikQ3V0H9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930596D02RikQ3V0H9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930596D02RikQ3V0H9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930596D02RikQ3V0H9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930596D02RikQ3V0H9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930596D02RikQ3V0H9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930596D02RikQ3V0H9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930596D02RikQ3V0H9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930596D02RikQ3V0H9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930596D02RikQ3V0H9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930596D02RikQ3V0H9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930596D02RikQ3V0H9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930596D02RikQ3V0H9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930596D02RikQ3V0H9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930596D02RikQ3V0H9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930596D02RikQ3V0H9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
4930596D02RikQ3V0H9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930596D02RikQ3V0H9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930596D02RikQ3V0H9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930596D02RikQ3V0H9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms