Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWM4

Kdm7a, Lysine-specific demethylase 7A, mousemouse

Predictions only

Length 940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm7aQ3UWM4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm7aQ3UWM4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm7aQ3UWM4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm7aQ3UWM4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm7aQ3UWM4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kdm7aQ3UWM4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kdm7aQ3UWM4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kdm7aQ3UWM4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kdm7aQ3UWM4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kdm7aQ3UWM4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kdm7aQ3UWM4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kdm7aQ3UWM4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm7aQ3UWM4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm7aQ3UWM4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm7aQ3UWM4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm7aQ3UWM4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm7aQ3UWM4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm7aQ3UWM4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm7aQ3UWM4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm7aQ3UWM4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm7aQ3UWM4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm7aQ3UWM4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm7aQ3UWM4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm7aQ3UWM4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm7aQ3UWM4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm7aQ3UWM4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm7aQ3UWM4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm7aQ3UWM4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm7aQ3UWM4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdm7aQ3UWM4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm7aQ3UWM4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm7aQ3UWM4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm7aQ3UWM4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm7aQ3UWM4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm7aQ3UWM4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm7aQ3UWM4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm7aQ3UWM4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm7aQ3UWM4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm7aQ3UWM4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm7aQ3UWM4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm7aQ3UWM4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdm7aQ3UWM4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm7aQ3UWM4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm7aQ3UWM4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm7aQ3UWM4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm7aQ3UWM4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm7aQ3UWM4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm7aQ3UWM4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm7aQ3UWM4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kdm7aQ3UWM4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kdm7aQ3UWM4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm7aQ3UWM4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm7aQ3UWM4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm7aQ3UWM4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm7aQ3UWM4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm7aQ3UWM4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm7aQ3UWM4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm7aQ3UWM4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm7aQ3UWM4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kdm7aQ3UWM4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kdm7aQ3UWM4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kdm7aQ3UWM4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kdm7aQ3UWM4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kdm7aQ3UWM4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kdm7aQ3UWM4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kdm7aQ3UWM4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kdm7aQ3UWM4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kdm7aQ3UWM4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm7aQ3UWM4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm7aQ3UWM4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm7aQ3UWM4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm7aQ3UWM4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm7aQ3UWM4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm7aQ3UWM4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm7aQ3UWM4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm7aQ3UWM4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm7aQ3UWM4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm7aQ3UWM4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm7aQ3UWM4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm7aQ3UWM4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm7aQ3UWM4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm7aQ3UWM4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm7aQ3UWM4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm7aQ3UWM4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm7aQ3UWM4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm7aQ3UWM4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm7aQ3UWM4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Kdm7aQ3UWM4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm7aQ3UWM4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm7aQ3UWM4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm7aQ3UWM4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm7aQ3UWM4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm7aQ3UWM4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm7aQ3UWM4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm7aQ3UWM4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm7aQ3UWM4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm7aQ3UWM4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm7aQ3UWM4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm7aQ3UWM4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm7aQ3UWM4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms