Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clpsl2Q3UW21 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clpsl2Q3UW21 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clpsl2Q3UW21 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clpsl2Q3UW21 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clpsl2Q3UW21 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Clpsl2Q3UW21 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clpsl2Q3UW21 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clpsl2Q3UW21 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clpsl2Q3UW21 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clpsl2Q3UW21 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Clpsl2Q3UW21 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clpsl2Q3UW21 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clpsl2Q3UW21 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clpsl2Q3UW21 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clpsl2Q3UW21 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Clpsl2Q3UW21 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clpsl2Q3UW21 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clpsl2Q3UW21 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clpsl2Q3UW21 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clpsl2Q3UW21 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clpsl2Q3UW21 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clpsl2Q3UW21 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clpsl2Q3UW21 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clpsl2Q3UW21 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clpsl2Q3UW21 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clpsl2Q3UW21 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clpsl2Q3UW21 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clpsl2Q3UW21 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clpsl2Q3UW21 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clpsl2Q3UW21 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clpsl2Q3UW21 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clpsl2Q3UW21 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clpsl2Q3UW21 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clpsl2Q3UW21 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clpsl2Q3UW21 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clpsl2Q3UW21 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clpsl2Q3UW21 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clpsl2Q3UW21 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clpsl2Q3UW21 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clpsl2Q3UW21 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clpsl2Q3UW21 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clpsl2Q3UW21 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clpsl2Q3UW21 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clpsl2Q3UW21 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clpsl2Q3UW21 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clpsl2Q3UW21 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clpsl2Q3UW21 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clpsl2Q3UW21 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clpsl2Q3UW21 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clpsl2Q3UW21 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clpsl2Q3UW21 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clpsl2Q3UW21 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clpsl2Q3UW21 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clpsl2Q3UW21 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clpsl2Q3UW21 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clpsl2Q3UW21 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clpsl2Q3UW21 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clpsl2Q3UW21 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Clpsl2Q3UW21 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms