Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nr1d1Q3UV55 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nr1d1Q3UV55 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nr1d1Q3UV55 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nr1d1Q3UV55 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nr1d1Q3UV55 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nr1d1Q3UV55 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Nr1d1Q3UV55 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nr1d1Q3UV55 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nr1d1Q3UV55 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nr1d1Q3UV55 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nr1d1Q3UV55 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nr1d1Q3UV55 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nr1d1Q3UV55 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nr1d1Q3UV55 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nr1d1Q3UV55 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nr1d1Q3UV55 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nr1d1Q3UV55 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nr1d1Q3UV55 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nr1d1Q3UV55 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nr1d1Q3UV55 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nr1d1Q3UV55 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nr1d1Q3UV55 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nr1d1Q3UV55 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nr1d1Q3UV55 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nr1d1Q3UV55 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nr1d1Q3UV55 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nr1d1Q3UV55 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nr1d1Q3UV55 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nr1d1Q3UV55 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nr1d1Q3UV55 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nr1d1Q3UV55 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nr1d1Q3UV55 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nr1d1Q3UV55 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nr1d1Q3UV55 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nr1d1Q3UV55 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nr1d1Q3UV55 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nr1d1Q3UV55 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nr1d1Q3UV55 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nr1d1Q3UV55 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nr1d1Q3UV55 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nr1d1Q3UV55 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nr1d1Q3UV55 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nr1d1Q3UV55 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nr1d1Q3UV55 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nr1d1Q3UV55 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nr1d1Q3UV55 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nr1d1Q3UV55 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nr1d1Q3UV55 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nr1d1Q3UV55 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nr1d1Q3UV55 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nr1d1Q3UV55 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nr1d1Q3UV55 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nr1d1Q3UV55 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nr1d1Q3UV55 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nr1d1Q3UV55 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nr1d1Q3UV55 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nr1d1Q3UV55 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nr1d1Q3UV55 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nr1d1Q3UV55 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nr1d1Q3UV55 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nr1d1Q3UV55 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nr1d1Q3UV55 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Nr1d1Q3UV55 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nr1d1Q3UV55 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Nr1d1Q3UV55 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nr1d1Q3UV55 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nr1d1Q3UV55 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nr1d1Q3UV55 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nr1d1Q3UV55 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Nr1d1Q3UV55 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nr1d1Q3UV55 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nr1d1Q3UV55 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nr1d1Q3UV55 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nr1d1Q3UV55 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nr1d1Q3UV55 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nr1d1Q3UV55 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nr1d1Q3UV55 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nr1d1Q3UV55 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nr1d1Q3UV55 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nr1d1Q3UV55 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nr1d1Q3UV55 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nr1d1Q3UV55 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nr1d1Q3UV55 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nr1d1Q3UV55 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nr1d1Q3UV55 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nr1d1Q3UV55 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nr1d1Q3UV55 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nr1d1Q3UV55 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nr1d1Q3UV55 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nr1d1Q3UV55 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nr1d1Q3UV55 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nr1d1Q3UV55 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nr1d1Q3UV55 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nr1d1Q3UV55 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nr1d1Q3UV55 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nr1d1Q3UV55 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nr1d1Q3UV55 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nr1d1Q3UV55 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nr1d1Q3UV55 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms