Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtl4Q3URY0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtl4Q3URY0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtl4Q3URY0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtl4Q3URY0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtl4Q3URY0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtl4Q3URY0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtl4Q3URY0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtl4Q3URY0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtl4Q3URY0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rtl4Q3URY0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rtl4Q3URY0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtl4Q3URY0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtl4Q3URY0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtl4Q3URY0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtl4Q3URY0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtl4Q3URY0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rtl4Q3URY0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtl4Q3URY0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtl4Q3URY0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rtl4Q3URY0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtl4Q3URY0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtl4Q3URY0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtl4Q3URY0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rtl4Q3URY0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtl4Q3URY0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtl4Q3URY0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtl4Q3URY0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rtl4Q3URY0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtl4Q3URY0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rtl4Q3URY0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtl4Q3URY0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtl4Q3URY0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtl4Q3URY0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtl4Q3URY0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtl4Q3URY0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtl4Q3URY0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rtl4Q3URY0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rtl4Q3URY0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rtl4Q3URY0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rtl4Q3URY0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rtl4Q3URY0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rtl4Q3URY0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rtl4Q3URY0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rtl4Q3URY0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rtl4Q3URY0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rtl4Q3URY0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rtl4Q3URY0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rtl4Q3URY0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rtl4Q3URY0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rtl4Q3URY0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtl4Q3URY0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtl4Q3URY0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtl4Q3URY0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rtl4Q3URY0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rtl4Q3URY0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rtl4Q3URY0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rtl4Q3URY0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rtl4Q3URY0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rtl4Q3URY0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rtl4Q3URY0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rtl4Q3URY0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rtl4Q3URY0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rtl4Q3URY0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rtl4Q3URY0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rtl4Q3URY0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rtl4Q3URY0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rtl4Q3URY0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rtl4Q3URY0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rtl4Q3URY0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rtl4Q3URY0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rtl4Q3URY0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rtl4Q3URY0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rtl4Q3URY0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtl4Q3URY0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtl4Q3URY0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtl4Q3URY0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtl4Q3URY0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtl4Q3URY0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtl4Q3URY0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtl4Q3URY0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtl4Q3URY0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtl4Q3URY0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtl4Q3URY0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtl4Q3URY0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtl4Q3URY0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtl4Q3URY0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtl4Q3URY0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtl4Q3URY0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rtl4Q3URY0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rtl4Q3URY0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rtl4Q3URY0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtl4Q3URY0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtl4Q3URY0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rtl4Q3URY0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rtl4Q3URY0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rtl4Q3URY0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rtl4Q3URY0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rtl4Q3URY0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rtl4Q3URY0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms