Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ41

Tmprss11a, Transmembrane protease serine 11A, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11aQ3UQ41 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmprss11aQ3UQ41 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmprss11aQ3UQ41 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmprss11aQ3UQ41 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmprss11aQ3UQ41 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmprss11aQ3UQ41 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmprss11aQ3UQ41 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmprss11aQ3UQ41 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmprss11aQ3UQ41 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmprss11aQ3UQ41 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tmprss11aQ3UQ41 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmprss11aQ3UQ41 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmprss11aQ3UQ41 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmprss11aQ3UQ41 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmprss11aQ3UQ41 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmprss11aQ3UQ41 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmprss11aQ3UQ41 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmprss11aQ3UQ41 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmprss11aQ3UQ41 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmprss11aQ3UQ41 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmprss11aQ3UQ41 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmprss11aQ3UQ41 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmprss11aQ3UQ41 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmprss11aQ3UQ41 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmprss11aQ3UQ41 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmprss11aQ3UQ41 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmprss11aQ3UQ41 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmprss11aQ3UQ41 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmprss11aQ3UQ41 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmprss11aQ3UQ41 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmprss11aQ3UQ41 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmprss11aQ3UQ41 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmprss11aQ3UQ41 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmprss11aQ3UQ41 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmprss11aQ3UQ41 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmprss11aQ3UQ41 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmprss11aQ3UQ41 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmprss11aQ3UQ41 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmprss11aQ3UQ41 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmprss11aQ3UQ41 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmprss11aQ3UQ41 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmprss11aQ3UQ41 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tmprss11aQ3UQ41 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmprss11aQ3UQ41 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmprss11aQ3UQ41 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmprss11aQ3UQ41 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmprss11aQ3UQ41 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmprss11aQ3UQ41 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmprss11aQ3UQ41 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmprss11aQ3UQ41 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmprss11aQ3UQ41 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmprss11aQ3UQ41 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmprss11aQ3UQ41 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmprss11aQ3UQ41 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmprss11aQ3UQ41 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmprss11aQ3UQ41 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmprss11aQ3UQ41 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmprss11aQ3UQ41 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmprss11aQ3UQ41 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmprss11aQ3UQ41 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmprss11aQ3UQ41 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmprss11aQ3UQ41 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmprss11aQ3UQ41 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmprss11aQ3UQ41 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmprss11aQ3UQ41 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmprss11aQ3UQ41 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmprss11aQ3UQ41 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmprss11aQ3UQ41 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmprss11aQ3UQ41 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmprss11aQ3UQ41 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmprss11aQ3UQ41 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmprss11aQ3UQ41 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmprss11aQ3UQ41 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmprss11aQ3UQ41 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmprss11aQ3UQ41 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmprss11aQ3UQ41 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmprss11aQ3UQ41 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmprss11aQ3UQ41 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmprss11aQ3UQ41 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmprss11aQ3UQ41 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmprss11aQ3UQ41 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmprss11aQ3UQ41 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmprss11aQ3UQ41 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmprss11aQ3UQ41 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmprss11aQ3UQ41 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmprss11aQ3UQ41 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmprss11aQ3UQ41 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmprss11aQ3UQ41 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmprss11aQ3UQ41 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmprss11aQ3UQ41 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmprss11aQ3UQ41 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmprss11aQ3UQ41 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmprss11aQ3UQ41 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmprss11aQ3UQ41 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmprss11aQ3UQ41 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmprss11aQ3UQ41 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmprss11aQ3UQ41 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmprss11aQ3UQ41 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmprss11aQ3UQ41 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmprss11aQ3UQ41 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms