Protein–RNA interactions for Protein: Q3UME2

Tmem241, Transmembrane protein 241, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem241Q3UME2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem241Q3UME2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem241Q3UME2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem241Q3UME2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem241Q3UME2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem241Q3UME2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem241Q3UME2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem241Q3UME2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem241Q3UME2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem241Q3UME2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem241Q3UME2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem241Q3UME2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem241Q3UME2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem241Q3UME2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem241Q3UME2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem241Q3UME2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem241Q3UME2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem241Q3UME2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem241Q3UME2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem241Q3UME2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem241Q3UME2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem241Q3UME2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem241Q3UME2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem241Q3UME2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem241Q3UME2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem241Q3UME2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem241Q3UME2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem241Q3UME2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem241Q3UME2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem241Q3UME2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem241Q3UME2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem241Q3UME2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem241Q3UME2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem241Q3UME2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem241Q3UME2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem241Q3UME2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem241Q3UME2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem241Q3UME2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem241Q3UME2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem241Q3UME2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem241Q3UME2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem241Q3UME2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem241Q3UME2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem241Q3UME2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem241Q3UME2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem241Q3UME2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem241Q3UME2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem241Q3UME2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem241Q3UME2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem241Q3UME2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem241Q3UME2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem241Q3UME2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem241Q3UME2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem241Q3UME2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem241Q3UME2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem241Q3UME2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem241Q3UME2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem241Q3UME2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem241Q3UME2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem241Q3UME2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem241Q3UME2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem241Q3UME2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem241Q3UME2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem241Q3UME2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem241Q3UME2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem241Q3UME2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem241Q3UME2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem241Q3UME2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem241Q3UME2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem241Q3UME2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem241Q3UME2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem241Q3UME2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem241Q3UME2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem241Q3UME2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem241Q3UME2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem241Q3UME2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem241Q3UME2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem241Q3UME2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem241Q3UME2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem241Q3UME2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem241Q3UME2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem241Q3UME2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem241Q3UME2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem241Q3UME2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem241Q3UME2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem241Q3UME2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem241Q3UME2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem241Q3UME2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem241Q3UME2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem241Q3UME2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem241Q3UME2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem241Q3UME2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem241Q3UME2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem241Q3UME2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem241Q3UME2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem241Q3UME2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem241Q3UME2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem241Q3UME2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem241Q3UME2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem241Q3UME2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms