Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc58Q3UGP9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc58Q3UGP9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc58Q3UGP9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc58Q3UGP9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc58Q3UGP9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc58Q3UGP9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc58Q3UGP9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc58Q3UGP9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc58Q3UGP9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc58Q3UGP9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc58Q3UGP9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc58Q3UGP9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc58Q3UGP9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc58Q3UGP9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc58Q3UGP9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc58Q3UGP9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc58Q3UGP9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc58Q3UGP9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc58Q3UGP9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc58Q3UGP9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc58Q3UGP9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc58Q3UGP9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc58Q3UGP9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc58Q3UGP9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc58Q3UGP9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc58Q3UGP9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc58Q3UGP9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc58Q3UGP9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc58Q3UGP9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc58Q3UGP9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc58Q3UGP9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc58Q3UGP9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc58Q3UGP9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc58Q3UGP9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc58Q3UGP9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc58Q3UGP9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc58Q3UGP9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc58Q3UGP9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc58Q3UGP9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc58Q3UGP9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc58Q3UGP9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc58Q3UGP9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc58Q3UGP9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc58Q3UGP9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc58Q3UGP9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc58Q3UGP9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc58Q3UGP9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc58Q3UGP9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc58Q3UGP9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc58Q3UGP9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc58Q3UGP9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc58Q3UGP9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc58Q3UGP9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc58Q3UGP9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc58Q3UGP9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc58Q3UGP9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc58Q3UGP9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc58Q3UGP9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc58Q3UGP9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc58Q3UGP9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc58Q3UGP9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc58Q3UGP9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc58Q3UGP9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc58Q3UGP9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc58Q3UGP9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc58Q3UGP9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrrc58Q3UGP9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc58Q3UGP9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc58Q3UGP9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc58Q3UGP9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc58Q3UGP9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc58Q3UGP9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc58Q3UGP9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc58Q3UGP9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc58Q3UGP9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc58Q3UGP9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc58Q3UGP9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc58Q3UGP9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc58Q3UGP9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc58Q3UGP9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc58Q3UGP9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc58Q3UGP9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc58Q3UGP9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc58Q3UGP9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc58Q3UGP9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc58Q3UGP9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc58Q3UGP9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc58Q3UGP9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc58Q3UGP9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc58Q3UGP9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc58Q3UGP9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc58Q3UGP9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc58Q3UGP9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc58Q3UGP9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc58Q3UGP9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc58Q3UGP9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc58Q3UGP9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc58Q3UGP9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms