Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBX0

Tmem109, Transmembrane protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem109Q3UBX0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tmem109Q3UBX0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tmem109Q3UBX0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tmem109Q3UBX0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tmem109Q3UBX0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tmem109Q3UBX0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tmem109Q3UBX0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tmem109Q3UBX0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tmem109Q3UBX0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tmem109Q3UBX0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tmem109Q3UBX0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tmem109Q3UBX0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tmem109Q3UBX0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tmem109Q3UBX0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tmem109Q3UBX0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tmem109Q3UBX0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tmem109Q3UBX0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tmem109Q3UBX0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tmem109Q3UBX0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tmem109Q3UBX0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tmem109Q3UBX0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Tmem109Q3UBX0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tmem109Q3UBX0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tmem109Q3UBX0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tmem109Q3UBX0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tmem109Q3UBX0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tmem109Q3UBX0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tmem109Q3UBX0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tmem109Q3UBX0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tmem109Q3UBX0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tmem109Q3UBX0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tmem109Q3UBX0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Tmem109Q3UBX0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tmem109Q3UBX0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmem109Q3UBX0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tmem109Q3UBX0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Tmem109Q3UBX0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tmem109Q3UBX0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tmem109Q3UBX0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tmem109Q3UBX0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tmem109Q3UBX0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tmem109Q3UBX0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tmem109Q3UBX0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tmem109Q3UBX0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tmem109Q3UBX0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmem109Q3UBX0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmem109Q3UBX0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmem109Q3UBX0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmem109Q3UBX0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tmem109Q3UBX0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tmem109Q3UBX0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tmem109Q3UBX0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tmem109Q3UBX0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tmem109Q3UBX0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tmem109Q3UBX0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tmem109Q3UBX0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmem109Q3UBX0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmem109Q3UBX0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmem109Q3UBX0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmem109Q3UBX0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmem109Q3UBX0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmem109Q3UBX0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmem109Q3UBX0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmem109Q3UBX0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmem109Q3UBX0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmem109Q3UBX0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmem109Q3UBX0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmem109Q3UBX0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmem109Q3UBX0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tmem109Q3UBX0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tmem109Q3UBX0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Tmem109Q3UBX0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tmem109Q3UBX0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tmem109Q3UBX0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tmem109Q3UBX0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmem109Q3UBX0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmem109Q3UBX0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Tmem109Q3UBX0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tmem109Q3UBX0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tmem109Q3UBX0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmem109Q3UBX0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmem109Q3UBX0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmem109Q3UBX0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmem109Q3UBX0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmem109Q3UBX0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmem109Q3UBX0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmem109Q3UBX0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmem109Q3UBX0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmem109Q3UBX0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmem109Q3UBX0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tmem109Q3UBX0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tmem109Q3UBX0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tmem109Q3UBX0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmem109Q3UBX0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmem109Q3UBX0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmem109Q3UBX0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tmem109Q3UBX0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tmem109Q3UBX0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tmem109Q3UBX0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tmem109Q3UBX0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms