Protein–RNA interactions for Protein: Q3U552

A930003A15Rik, RIKEN cDNA A930003A15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A930003A15RikQ3U552 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A930003A15RikQ3U552 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A930003A15RikQ3U552 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A930003A15RikQ3U552 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A930003A15RikQ3U552 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A930003A15RikQ3U552 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A930003A15RikQ3U552 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A930003A15RikQ3U552 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A930003A15RikQ3U552 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A930003A15RikQ3U552 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A930003A15RikQ3U552 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A930003A15RikQ3U552 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A930003A15RikQ3U552 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
A930003A15RikQ3U552 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A930003A15RikQ3U552 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A930003A15RikQ3U552 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A930003A15RikQ3U552 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A930003A15RikQ3U552 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A930003A15RikQ3U552 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A930003A15RikQ3U552 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A930003A15RikQ3U552 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A930003A15RikQ3U552 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A930003A15RikQ3U552 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A930003A15RikQ3U552 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A930003A15RikQ3U552 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
A930003A15RikQ3U552 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
A930003A15RikQ3U552 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A930003A15RikQ3U552 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A930003A15RikQ3U552 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A930003A15RikQ3U552 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A930003A15RikQ3U552 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
A930003A15RikQ3U552 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A930003A15RikQ3U552 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A930003A15RikQ3U552 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
A930003A15RikQ3U552 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A930003A15RikQ3U552 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
A930003A15RikQ3U552 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A930003A15RikQ3U552 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A930003A15RikQ3U552 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A930003A15RikQ3U552 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A930003A15RikQ3U552 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A930003A15RikQ3U552 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A930003A15RikQ3U552 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A930003A15RikQ3U552 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A930003A15RikQ3U552 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
A930003A15RikQ3U552 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
A930003A15RikQ3U552 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A930003A15RikQ3U552 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
A930003A15RikQ3U552 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A930003A15RikQ3U552 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
A930003A15RikQ3U552 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A930003A15RikQ3U552 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A930003A15RikQ3U552 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A930003A15RikQ3U552 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A930003A15RikQ3U552 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A930003A15RikQ3U552 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A930003A15RikQ3U552 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A930003A15RikQ3U552 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A930003A15RikQ3U552 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A930003A15RikQ3U552 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A930003A15RikQ3U552 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A930003A15RikQ3U552 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A930003A15RikQ3U552 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A930003A15RikQ3U552 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A930003A15RikQ3U552 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
A930003A15RikQ3U552 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A930003A15RikQ3U552 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
A930003A15RikQ3U552 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A930003A15RikQ3U552 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A930003A15RikQ3U552 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A930003A15RikQ3U552 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A930003A15RikQ3U552 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A930003A15RikQ3U552 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A930003A15RikQ3U552 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A930003A15RikQ3U552 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A930003A15RikQ3U552 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A930003A15RikQ3U552 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A930003A15RikQ3U552 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A930003A15RikQ3U552 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A930003A15RikQ3U552 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A930003A15RikQ3U552 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A930003A15RikQ3U552 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A930003A15RikQ3U552 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
A930003A15RikQ3U552 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A930003A15RikQ3U552 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
A930003A15RikQ3U552 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
A930003A15RikQ3U552 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
A930003A15RikQ3U552 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A930003A15RikQ3U552 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
A930003A15RikQ3U552 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
A930003A15RikQ3U552 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
A930003A15RikQ3U552 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
A930003A15RikQ3U552 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
A930003A15RikQ3U552 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
A930003A15RikQ3U552 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A930003A15RikQ3U552 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A930003A15RikQ3U552 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A930003A15RikQ3U552 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A930003A15RikQ3U552 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A930003A15RikQ3U552 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms