Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nlrp4cQ3TKR3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nlrp4cQ3TKR3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nlrp4cQ3TKR3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nlrp4cQ3TKR3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nlrp4cQ3TKR3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nlrp4cQ3TKR3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nlrp4cQ3TKR3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nlrp4cQ3TKR3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nlrp4cQ3TKR3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nlrp4cQ3TKR3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nlrp4cQ3TKR3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nlrp4cQ3TKR3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nlrp4cQ3TKR3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nlrp4cQ3TKR3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nlrp4cQ3TKR3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nlrp4cQ3TKR3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nlrp4cQ3TKR3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nlrp4cQ3TKR3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nlrp4cQ3TKR3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nlrp4cQ3TKR3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nlrp4cQ3TKR3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nlrp4cQ3TKR3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nlrp4cQ3TKR3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nlrp4cQ3TKR3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nlrp4cQ3TKR3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nlrp4cQ3TKR3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nlrp4cQ3TKR3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Nlrp4cQ3TKR3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nlrp4cQ3TKR3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nlrp4cQ3TKR3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nlrp4cQ3TKR3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Nlrp4cQ3TKR3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nlrp4cQ3TKR3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nlrp4cQ3TKR3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nlrp4cQ3TKR3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nlrp4cQ3TKR3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nlrp4cQ3TKR3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nlrp4cQ3TKR3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nlrp4cQ3TKR3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlrp4cQ3TKR3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlrp4cQ3TKR3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlrp4cQ3TKR3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlrp4cQ3TKR3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlrp4cQ3TKR3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlrp4cQ3TKR3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlrp4cQ3TKR3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlrp4cQ3TKR3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nlrp4cQ3TKR3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nlrp4cQ3TKR3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nlrp4cQ3TKR3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nlrp4cQ3TKR3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nlrp4cQ3TKR3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nlrp4cQ3TKR3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nlrp4cQ3TKR3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nlrp4cQ3TKR3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nlrp4cQ3TKR3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nlrp4cQ3TKR3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nlrp4cQ3TKR3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nlrp4cQ3TKR3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nlrp4cQ3TKR3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nlrp4cQ3TKR3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nlrp4cQ3TKR3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nlrp4cQ3TKR3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nlrp4cQ3TKR3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nlrp4cQ3TKR3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nlrp4cQ3TKR3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Nlrp4cQ3TKR3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nlrp4cQ3TKR3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nlrp4cQ3TKR3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Nlrp4cQ3TKR3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nlrp4cQ3TKR3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nlrp4cQ3TKR3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nlrp4cQ3TKR3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nlrp4cQ3TKR3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nlrp4cQ3TKR3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nlrp4cQ3TKR3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nlrp4cQ3TKR3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nlrp4cQ3TKR3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nlrp4cQ3TKR3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nlrp4cQ3TKR3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nlrp4cQ3TKR3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nlrp4cQ3TKR3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nlrp4cQ3TKR3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nlrp4cQ3TKR3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nlrp4cQ3TKR3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nlrp4cQ3TKR3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nlrp4cQ3TKR3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nlrp4cQ3TKR3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nlrp4cQ3TKR3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nlrp4cQ3TKR3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nlrp4cQ3TKR3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nlrp4cQ3TKR3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nlrp4cQ3TKR3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nlrp4cQ3TKR3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nlrp4cQ3TKR3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nlrp4cQ3TKR3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nlrp4cQ3TKR3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nlrp4cQ3TKR3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nlrp4cQ3TKR3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms