Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI48

Jsrp1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jsrp1Q3MI48 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Jsrp1Q3MI48 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Jsrp1Q3MI48 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Jsrp1Q3MI48 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Jsrp1Q3MI48 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Jsrp1Q3MI48 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Jsrp1Q3MI48 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Jsrp1Q3MI48 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Jsrp1Q3MI48 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Jsrp1Q3MI48 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Jsrp1Q3MI48 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Jsrp1Q3MI48 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Jsrp1Q3MI48 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Jsrp1Q3MI48 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Jsrp1Q3MI48 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Jsrp1Q3MI48 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Jsrp1Q3MI48 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Jsrp1Q3MI48 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Jsrp1Q3MI48 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Jsrp1Q3MI48 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Jsrp1Q3MI48 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Jsrp1Q3MI48 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Jsrp1Q3MI48 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Jsrp1Q3MI48 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Jsrp1Q3MI48 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Jsrp1Q3MI48 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Jsrp1Q3MI48 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Jsrp1Q3MI48 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Jsrp1Q3MI48 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Jsrp1Q3MI48 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Jsrp1Q3MI48 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Jsrp1Q3MI48 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Jsrp1Q3MI48 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Jsrp1Q3MI48 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Jsrp1Q3MI48 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Jsrp1Q3MI48 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Jsrp1Q3MI48 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Jsrp1Q3MI48 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Jsrp1Q3MI48 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Jsrp1Q3MI48 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Jsrp1Q3MI48 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Jsrp1Q3MI48 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Jsrp1Q3MI48 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Jsrp1Q3MI48 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Jsrp1Q3MI48 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Jsrp1Q3MI48 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Jsrp1Q3MI48 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Jsrp1Q3MI48 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Jsrp1Q3MI48 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Jsrp1Q3MI48 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Jsrp1Q3MI48 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Jsrp1Q3MI48 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Jsrp1Q3MI48 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Jsrp1Q3MI48 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Jsrp1Q3MI48 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Jsrp1Q3MI48 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Jsrp1Q3MI48 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Jsrp1Q3MI48 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Jsrp1Q3MI48 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Jsrp1Q3MI48 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Jsrp1Q3MI48 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Jsrp1Q3MI48 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Jsrp1Q3MI48 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Jsrp1Q3MI48 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Jsrp1Q3MI48 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Jsrp1Q3MI48 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jsrp1Q3MI48 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jsrp1Q3MI48 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jsrp1Q3MI48 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jsrp1Q3MI48 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jsrp1Q3MI48 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jsrp1Q3MI48 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jsrp1Q3MI48 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jsrp1Q3MI48 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jsrp1Q3MI48 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jsrp1Q3MI48 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jsrp1Q3MI48 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jsrp1Q3MI48 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jsrp1Q3MI48 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jsrp1Q3MI48 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Jsrp1Q3MI48 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jsrp1Q3MI48 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jsrp1Q3MI48 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jsrp1Q3MI48 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Jsrp1Q3MI48 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Jsrp1Q3MI48 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jsrp1Q3MI48 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jsrp1Q3MI48 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jsrp1Q3MI48 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jsrp1Q3MI48 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Jsrp1Q3MI48 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jsrp1Q3MI48 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Jsrp1Q3MI48 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Jsrp1Q3MI48 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Jsrp1Q3MI48 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Jsrp1Q3MI48 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Jsrp1Q3MI48 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Jsrp1Q3MI48 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Jsrp1Q3MI48 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Jsrp1Q3MI48 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms