Protein–RNA interactions for Protein: Q2PFD7

Psd3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psd3Q2PFD7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Psd3Q2PFD7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Psd3Q2PFD7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Psd3Q2PFD7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Psd3Q2PFD7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Psd3Q2PFD7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Psd3Q2PFD7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Psd3Q2PFD7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Psd3Q2PFD7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Psd3Q2PFD7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Psd3Q2PFD7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Psd3Q2PFD7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Psd3Q2PFD7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Psd3Q2PFD7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Psd3Q2PFD7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Psd3Q2PFD7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Psd3Q2PFD7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Psd3Q2PFD7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Psd3Q2PFD7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Psd3Q2PFD7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Psd3Q2PFD7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Psd3Q2PFD7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Psd3Q2PFD7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Psd3Q2PFD7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Psd3Q2PFD7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Psd3Q2PFD7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Psd3Q2PFD7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Psd3Q2PFD7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Psd3Q2PFD7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Psd3Q2PFD7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Psd3Q2PFD7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Psd3Q2PFD7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Psd3Q2PFD7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Psd3Q2PFD7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Psd3Q2PFD7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Psd3Q2PFD7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Psd3Q2PFD7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Psd3Q2PFD7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Psd3Q2PFD7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Psd3Q2PFD7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Psd3Q2PFD7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Psd3Q2PFD7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Psd3Q2PFD7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Psd3Q2PFD7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Psd3Q2PFD7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Psd3Q2PFD7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Psd3Q2PFD7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Psd3Q2PFD7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Psd3Q2PFD7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Psd3Q2PFD7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Psd3Q2PFD7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Psd3Q2PFD7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Psd3Q2PFD7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Psd3Q2PFD7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Psd3Q2PFD7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Psd3Q2PFD7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Psd3Q2PFD7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Psd3Q2PFD7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Psd3Q2PFD7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Psd3Q2PFD7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Psd3Q2PFD7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Psd3Q2PFD7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Psd3Q2PFD7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Psd3Q2PFD7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Psd3Q2PFD7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Psd3Q2PFD7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Psd3Q2PFD7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Psd3Q2PFD7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Psd3Q2PFD7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Psd3Q2PFD7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Psd3Q2PFD7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Psd3Q2PFD7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Psd3Q2PFD7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Psd3Q2PFD7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Psd3Q2PFD7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Psd3Q2PFD7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Psd3Q2PFD7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Psd3Q2PFD7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Psd3Q2PFD7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Psd3Q2PFD7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Psd3Q2PFD7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Psd3Q2PFD7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Psd3Q2PFD7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Psd3Q2PFD7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Psd3Q2PFD7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Psd3Q2PFD7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Psd3Q2PFD7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Psd3Q2PFD7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Psd3Q2PFD7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Psd3Q2PFD7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Psd3Q2PFD7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Psd3Q2PFD7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Psd3Q2PFD7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Psd3Q2PFD7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Psd3Q2PFD7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Psd3Q2PFD7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Psd3Q2PFD7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Psd3Q2PFD7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Psd3Q2PFD7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Psd3Q2PFD7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms