Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cpne9Q1RLL3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cpne9Q1RLL3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpne9Q1RLL3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cpne9Q1RLL3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cpne9Q1RLL3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cpne9Q1RLL3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cpne9Q1RLL3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cpne9Q1RLL3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cpne9Q1RLL3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cpne9Q1RLL3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cpne9Q1RLL3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cpne9Q1RLL3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cpne9Q1RLL3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cpne9Q1RLL3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cpne9Q1RLL3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cpne9Q1RLL3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cpne9Q1RLL3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpne9Q1RLL3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpne9Q1RLL3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpne9Q1RLL3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpne9Q1RLL3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpne9Q1RLL3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpne9Q1RLL3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cpne9Q1RLL3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cpne9Q1RLL3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpne9Q1RLL3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpne9Q1RLL3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpne9Q1RLL3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpne9Q1RLL3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpne9Q1RLL3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpne9Q1RLL3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpne9Q1RLL3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpne9Q1RLL3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpne9Q1RLL3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpne9Q1RLL3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpne9Q1RLL3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpne9Q1RLL3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpne9Q1RLL3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cpne9Q1RLL3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cpne9Q1RLL3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cpne9Q1RLL3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpne9Q1RLL3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpne9Q1RLL3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpne9Q1RLL3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpne9Q1RLL3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpne9Q1RLL3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpne9Q1RLL3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpne9Q1RLL3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpne9Q1RLL3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpne9Q1RLL3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpne9Q1RLL3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpne9Q1RLL3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpne9Q1RLL3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpne9Q1RLL3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpne9Q1RLL3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpne9Q1RLL3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpne9Q1RLL3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpne9Q1RLL3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpne9Q1RLL3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpne9Q1RLL3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cpne9Q1RLL3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpne9Q1RLL3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpne9Q1RLL3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpne9Q1RLL3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpne9Q1RLL3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpne9Q1RLL3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpne9Q1RLL3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpne9Q1RLL3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpne9Q1RLL3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpne9Q1RLL3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpne9Q1RLL3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpne9Q1RLL3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpne9Q1RLL3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpne9Q1RLL3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpne9Q1RLL3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpne9Q1RLL3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpne9Q1RLL3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpne9Q1RLL3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpne9Q1RLL3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpne9Q1RLL3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpne9Q1RLL3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpne9Q1RLL3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpne9Q1RLL3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpne9Q1RLL3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpne9Q1RLL3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpne9Q1RLL3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpne9Q1RLL3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpne9Q1RLL3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpne9Q1RLL3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpne9Q1RLL3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpne9Q1RLL3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpne9Q1RLL3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cpne9Q1RLL3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpne9Q1RLL3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpne9Q1RLL3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpne9Q1RLL3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cpne9Q1RLL3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms