Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim71Q1PSW8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim71Q1PSW8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim71Q1PSW8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim71Q1PSW8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim71Q1PSW8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim71Q1PSW8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim71Q1PSW8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim71Q1PSW8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim71Q1PSW8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim71Q1PSW8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim71Q1PSW8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim71Q1PSW8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim71Q1PSW8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim71Q1PSW8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim71Q1PSW8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim71Q1PSW8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim71Q1PSW8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim71Q1PSW8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim71Q1PSW8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim71Q1PSW8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim71Q1PSW8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim71Q1PSW8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim71Q1PSW8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim71Q1PSW8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim71Q1PSW8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim71Q1PSW8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim71Q1PSW8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim71Q1PSW8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim71Q1PSW8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim71Q1PSW8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim71Q1PSW8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim71Q1PSW8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim71Q1PSW8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim71Q1PSW8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim71Q1PSW8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim71Q1PSW8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim71Q1PSW8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim71Q1PSW8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim71Q1PSW8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim71Q1PSW8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim71Q1PSW8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim71Q1PSW8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim71Q1PSW8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim71Q1PSW8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim71Q1PSW8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim71Q1PSW8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim71Q1PSW8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim71Q1PSW8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim71Q1PSW8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim71Q1PSW8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim71Q1PSW8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim71Q1PSW8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim71Q1PSW8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim71Q1PSW8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim71Q1PSW8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim71Q1PSW8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim71Q1PSW8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim71Q1PSW8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim71Q1PSW8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim71Q1PSW8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim71Q1PSW8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
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