Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim71Q1PSW8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim71Q1PSW8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim71Q1PSW8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim71Q1PSW8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim71Q1PSW8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim71Q1PSW8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim71Q1PSW8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim71Q1PSW8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim71Q1PSW8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim71Q1PSW8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim71Q1PSW8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim71Q1PSW8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim71Q1PSW8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim71Q1PSW8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim71Q1PSW8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim71Q1PSW8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim71Q1PSW8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim71Q1PSW8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim71Q1PSW8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim71Q1PSW8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim71Q1PSW8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim71Q1PSW8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim71Q1PSW8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim71Q1PSW8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim71Q1PSW8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim71Q1PSW8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim71Q1PSW8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim71Q1PSW8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim71Q1PSW8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim71Q1PSW8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim71Q1PSW8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim71Q1PSW8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim71Q1PSW8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim71Q1PSW8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim71Q1PSW8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim71Q1PSW8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim71Q1PSW8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim71Q1PSW8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim71Q1PSW8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim71Q1PSW8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim71Q1PSW8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim71Q1PSW8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim71Q1PSW8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim71Q1PSW8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim71Q1PSW8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim71Q1PSW8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim71Q1PSW8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim71Q1PSW8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim71Q1PSW8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim71Q1PSW8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim71Q1PSW8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim71Q1PSW8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim71Q1PSW8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim71Q1PSW8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim71Q1PSW8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim71Q1PSW8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim71Q1PSW8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim71Q1PSW8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim71Q1PSW8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim71Q1PSW8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim71Q1PSW8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim71Q1PSW8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms