Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cd300lgQ1ERP8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cd300lgQ1ERP8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cd300lgQ1ERP8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cd300lgQ1ERP8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cd300lgQ1ERP8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cd300lgQ1ERP8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cd300lgQ1ERP8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cd300lgQ1ERP8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd300lgQ1ERP8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd300lgQ1ERP8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd300lgQ1ERP8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd300lgQ1ERP8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd300lgQ1ERP8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd300lgQ1ERP8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd300lgQ1ERP8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cd300lgQ1ERP8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cd300lgQ1ERP8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cd300lgQ1ERP8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cd300lgQ1ERP8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cd300lgQ1ERP8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cd300lgQ1ERP8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cd300lgQ1ERP8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cd300lgQ1ERP8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd300lgQ1ERP8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd300lgQ1ERP8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd300lgQ1ERP8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd300lgQ1ERP8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd300lgQ1ERP8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd300lgQ1ERP8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd300lgQ1ERP8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd300lgQ1ERP8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cd300lgQ1ERP8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd300lgQ1ERP8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd300lgQ1ERP8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd300lgQ1ERP8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd300lgQ1ERP8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd300lgQ1ERP8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd300lgQ1ERP8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd300lgQ1ERP8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd300lgQ1ERP8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd300lgQ1ERP8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd300lgQ1ERP8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd300lgQ1ERP8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd300lgQ1ERP8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd300lgQ1ERP8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd300lgQ1ERP8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd300lgQ1ERP8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd300lgQ1ERP8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd300lgQ1ERP8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd300lgQ1ERP8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd300lgQ1ERP8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd300lgQ1ERP8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd300lgQ1ERP8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd300lgQ1ERP8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd300lgQ1ERP8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd300lgQ1ERP8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd300lgQ1ERP8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd300lgQ1ERP8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd300lgQ1ERP8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd300lgQ1ERP8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd300lgQ1ERP8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd300lgQ1ERP8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd300lgQ1ERP8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd300lgQ1ERP8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd300lgQ1ERP8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd300lgQ1ERP8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd300lgQ1ERP8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd300lgQ1ERP8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd300lgQ1ERP8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd300lgQ1ERP8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd300lgQ1ERP8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd300lgQ1ERP8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cd300lgQ1ERP8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cd300lgQ1ERP8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd300lgQ1ERP8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd300lgQ1ERP8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd300lgQ1ERP8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd300lgQ1ERP8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd300lgQ1ERP8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd300lgQ1ERP8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd300lgQ1ERP8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd300lgQ1ERP8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd300lgQ1ERP8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd300lgQ1ERP8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd300lgQ1ERP8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd300lgQ1ERP8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd300lgQ1ERP8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd300lgQ1ERP8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cd300lgQ1ERP8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd300lgQ1ERP8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd300lgQ1ERP8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd300lgQ1ERP8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd300lgQ1ERP8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cd300lgQ1ERP8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cd300lgQ1ERP8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd300lgQ1ERP8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd300lgQ1ERP8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd300lgQ1ERP8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms