Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 NUP205-209ENST00000491089 553 ntTSL 27.36□□□□□ -1.232e-19■■■■■ 74.6
PCBP2Q15366 NUP205-208ENST00000490439 653 ntTSL 36.91□□□□□ -1.32e-19■■■■■ 74.6
PCBP2Q15366 NUP205-210ENST00000607647 4518 ntTSL 55.33□□□□□ -1.562e-19■■■■■ 74.6
PCBP2Q15366 NUP205-206ENST00000477620 1800 ntTSL 54.98□□□□□ -1.612e-19■■■■■ 74.6
PCBP2Q15366 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.551e-8■■■■■ 74.6
PCBP2Q15366 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.472e-7■■■■■ 74.2
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PCBP2Q15366 ATP11A-212ENST00000487903 8858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.812e-7■■■■■ 74.2
PCBP2Q15366 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.323e-6■■■■■ 74.2
PCBP2Q15366 MAP4K4-211ENST00000427603 526 ntTSL 49.11□□□□□ -0.951e-8■■■■■ 74.1
PCBP2Q15366 KIF2A-209ENST00000512541 549 ntTSL 416.98■□□□□ 0.316e-16■■■■■ 74.1
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PCBP2Q15366 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.717e-13■■■■■ 74.1
PCBP2Q15366 EIF4G2-207ENST00000525995 592 ntTSL 420.05■□□□□ 0.83e-65■■■■■ 74
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PCBP2Q15366 EIF4G2-221ENST00000532082 1069 ntTSL 1 (best)10.71□□□□□ -0.693e-65■■■■■ 74
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PCBP2Q15366 EIF4G2-202ENST00000396525 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.133e-65■■■■■ 74
PCBP2Q15366 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.213e-65■■■■■ 74
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PCBP2Q15366 ZC4H2-202ENST00000374839 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.66e-17■■■■■ 73.8
PCBP2Q15366 ZC4H2-201ENST00000337990 2363 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.826e-17■■■■■ 73.8
PCBP2Q15366 ZC4H2-204ENST00000476032 841 ntTSL 39.4□□□□□ -0.96e-17■■■■■ 73.8
PCBP2Q15366 ZC4H2-203ENST00000447788 2649 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.936e-17■■■■■ 73.8
PCBP2Q15366 ZC4H2-207ENST00000488831 606 ntTSL 29□□□□□ -0.976e-17■■■■■ 73.8
PCBP2Q15366 ZC4H2-208ENST00000492653 806 ntTSL 58.94□□□□□ -0.986e-17■■■■■ 73.8
PCBP2Q15366 ZC4H2-206ENST00000488608 4147 ntTSL 26.27□□□□□ -1.46e-17■■■■■ 73.8
PCBP2Q15366 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.353e-7■■■■■ 73.8
PCBP2Q15366 RSBN1L-203ENST00000445288 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.853e-7■■■■■ 73.8
PCBP2Q15366 RSBN1L-204ENST00000445512 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 37.73□□□□□ -1.173e-7■■■■■ 73.8
PCBP2Q15366 RSBN1L-206ENST00000468035 585 ntTSL 36.44□□□□□ -1.383e-7■■■■■ 73.8
PCBP2Q15366 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.675e-19■■■■■ 73.8
PCBP2Q15366 PPA1-205ENST00000610026 3524 ntTSL 28.23□□□□□ -1.095e-19■■■■■ 73.8
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PCBP2Q15366 TMEM2-210ENST00000542935 5372 ntTSL 1 (best)6.97□□□□□ -1.291e-12■■■■■ 73.6
PCBP2Q15366 TMEM2-212ENST00000545719 533 ntTSL 45.03□□□□□ -1.61e-12■■■■■ 73.6
PCBP2Q15366 STRAP-202ENST00000419869 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.311e-33■■■■■ 73.6
PCBP2Q15366 STRAP-206ENST00000541731 1698 ntTSL 29.71□□□□□ -0.851e-33■■■■■ 73.6
PCBP2Q15366 STRAP-201ENST00000025399 1442 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.911e-33■■■■■ 73.6
PCBP2Q15366 ADK-204ENST00000478611 443 ntTSL 311.5□□□□□ -0.572e-73■■■■■ 73.5
PCBP2Q15366 DPP9-224ENST00000601764 1909 ntTSL 517.81■□□□□ 0.444e-8■■■■■ 73.4
PCBP2Q15366 DPP9-209ENST00000597726 570 ntTSL 416.8■□□□□ 0.284e-8■■■■■ 73.4
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PCBP2Q15366 DPP9-215ENST00000599163 835 ntTSL 512.15□□□□□ -0.464e-8■■■■■ 73.4
PCBP2Q15366 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.872e-7■■■■■ 73.4
PCBP2Q15366 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.42e-7■■■■■ 73.4
PCBP2Q15366 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 73.4
PCBP2Q15366 JPT1-201ENST00000304834 1633 ntTSL 1 (best)16.05■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 73.4
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PCBP2Q15366 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 73.4
PCBP2Q15366 JPT1-208ENST00000481647 576 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 73.4
PCBP2Q15366 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.612e-7■■■■■ 73.4
PCBP2Q15366 JPT1-211ENST00000581874 517 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.142e-7■■■■■ 73.4
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PCBP2Q15366 SERINC5-205ENST00000513907 547 ntTSL 47□□□□□ -1.292e-16■■■■■ 73.4
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PCBP2Q15366 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.42e-21■■■■■ 73.3
PCBP2Q15366 SLC43A1-207ENST00000533066 999 ntTSL 316.83■□□□□ 0.282e-21■■■■■ 73.3
PCBP2Q15366 SLC43A1-210ENST00000534105 580 ntTSL 516.68■□□□□ 0.262e-21■■■■■ 73.3
PCBP2Q15366 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.12e-21■■■■■ 73.3
PCBP2Q15366 SLC43A1-206ENST00000530159 788 ntTSL 515.57■□□□□ 0.082e-21■■■■■ 73.3
PCBP2Q15366 SLC43A1-208ENST00000533263 690 ntTSL 515.47■□□□□ 0.072e-21■■■■■ 73.3
PCBP2Q15366 POLR2H-207ENST00000455712 823 ntTSL 312.07□□□□□ -0.488e-11■■■■■ 73.1
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PCBP2Q15366 AC008014.1-203ENST00000611243 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.913e-9■■■■■ 72.8
PCBP2Q15366 NBEAL1-210ENST00000497505 2372 ntTSL 512.35□□□□□ -0.431e-17■■■■■ 72.7
PCBP2Q15366 NBEAL1-207ENST00000478884 1012 ntTSL 1 (best)8.58□□□□□ -1.041e-17■■■■■ 72.7
PCBP2Q15366 NBEAL1-205ENST00000460416 518 ntTSL 58.01□□□□□ -1.131e-17■■■■■ 72.7
PCBP2Q15366 NBEAL1-209ENST00000492870 439 ntTSL 35.1□□□□□ -1.591e-17■■■■■ 72.7
PCBP2Q15366 TRRAP-205ENST00000456197 11654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)7.32□□□□□ -1.241e-11■■■■■ 72.6
PCBP2Q15366 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.321e-11■■■■■ 72.6
PCBP2Q15366 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.321e-11■■■■■ 72.6
PCBP2Q15366 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.341e-11■■■■■ 72.6
PCBP2Q15366 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.491e-11■■■■■ 72.6
PCBP2Q15366 KIFC3-213ENST00000563028 681 ntTSL 421.9■■□□□ 1.14e-21■■■■■ 72.3
PCBP2Q15366 ZC3H4-205ENST00000601973 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.45□□□□□ -0.14e-21■■■■■ 72.3
PCBP2Q15366 TCEA2-206ENST00000440819 1083 ntTSL 514.57□□□□□ -0.085e-28■■■■■ 72.1
PCBP2Q15366 TMEM120A-209ENST00000480899 765 ntTSL 512.83□□□□□ -0.366e-11■■■■■ 72
PCBP2Q15366 ZC3H18-204ENST00000564161 4654 ntTSL 213.82□□□□□ -0.22e-16■■■■■ 72
PCBP2Q15366 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.412e-16■■■■■ 72
PCBP2Q15366 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.561e-8■■■■■ 72
PCBP2Q15366 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.391e-8■■■■■ 72
PCBP2Q15366 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.251e-8■■■■■ 72
PCBP2Q15366 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.031e-8■■■■■ 72
PCBP2Q15366 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.071e-8■■■■■ 72
PCBP2Q15366 MAP4K4-212ENST00000456652 3855 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.11e-8■■■■■ 72
PCBP2Q15366 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.171e-8■■■■■ 72
PCBP2Q15366 MAP4K4-207ENST00000417294 4251 ntTSL 56□□□□□ -1.451e-8■■■■■ 72
PCBP2Q15366 SLC12A7-204ENST00000513223 1066 ntTSL 515.1■□□□□ 0.014e-9■■■■■ 71.9
PCBP2Q15366 MICALL2-208ENST00000472100 5248 ntTSL 217.28■□□□□ 0.363e-12■■■■■ 71.7
PCBP2Q15366 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.153e-12■■■■■ 71.7
PCBP2Q15366 MICALL2-210ENST00000482839 852 ntTSL 214.16□□□□□ -0.143e-12■■■■■ 71.7
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