Protein–RNA interactions for Protein: Q148W0

Atp8b1, Phospholipid-transporting ATPase IC, mousemouse

Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b1Q148W0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp8b1Q148W0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp8b1Q148W0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp8b1Q148W0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp8b1Q148W0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp8b1Q148W0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp8b1Q148W0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atp8b1Q148W0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp8b1Q148W0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp8b1Q148W0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp8b1Q148W0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp8b1Q148W0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp8b1Q148W0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp8b1Q148W0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp8b1Q148W0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp8b1Q148W0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp8b1Q148W0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp8b1Q148W0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp8b1Q148W0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp8b1Q148W0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp8b1Q148W0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp8b1Q148W0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp8b1Q148W0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp8b1Q148W0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp8b1Q148W0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp8b1Q148W0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp8b1Q148W0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp8b1Q148W0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp8b1Q148W0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp8b1Q148W0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp8b1Q148W0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp8b1Q148W0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp8b1Q148W0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp8b1Q148W0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp8b1Q148W0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp8b1Q148W0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp8b1Q148W0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp8b1Q148W0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp8b1Q148W0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp8b1Q148W0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp8b1Q148W0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp8b1Q148W0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp8b1Q148W0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp8b1Q148W0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp8b1Q148W0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp8b1Q148W0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp8b1Q148W0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp8b1Q148W0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp8b1Q148W0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp8b1Q148W0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp8b1Q148W0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp8b1Q148W0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp8b1Q148W0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp8b1Q148W0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp8b1Q148W0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp8b1Q148W0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp8b1Q148W0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp8b1Q148W0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp8b1Q148W0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp8b1Q148W0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp8b1Q148W0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp8b1Q148W0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp8b1Q148W0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp8b1Q148W0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp8b1Q148W0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp8b1Q148W0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp8b1Q148W0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp8b1Q148W0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp8b1Q148W0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp8b1Q148W0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp8b1Q148W0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp8b1Q148W0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp8b1Q148W0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp8b1Q148W0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp8b1Q148W0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp8b1Q148W0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp8b1Q148W0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp8b1Q148W0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp8b1Q148W0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atp8b1Q148W0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atp8b1Q148W0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atp8b1Q148W0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atp8b1Q148W0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp8b1Q148W0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp8b1Q148W0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp8b1Q148W0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp8b1Q148W0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp8b1Q148W0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp8b1Q148W0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp8b1Q148W0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp8b1Q148W0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp8b1Q148W0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp8b1Q148W0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp8b1Q148W0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp8b1Q148W0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp8b1Q148W0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp8b1Q148W0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp8b1Q148W0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp8b1Q148W0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp8b1Q148W0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms