Protein–RNA interactions for Protein: Q0EEE2

Ptchd3, Patched domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptchd3Q0EEE2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptchd3Q0EEE2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptchd3Q0EEE2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptchd3Q0EEE2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptchd3Q0EEE2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptchd3Q0EEE2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ptchd3Q0EEE2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ptchd3Q0EEE2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptchd3Q0EEE2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptchd3Q0EEE2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptchd3Q0EEE2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptchd3Q0EEE2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptchd3Q0EEE2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptchd3Q0EEE2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptchd3Q0EEE2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptchd3Q0EEE2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptchd3Q0EEE2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptchd3Q0EEE2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptchd3Q0EEE2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptchd3Q0EEE2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptchd3Q0EEE2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptchd3Q0EEE2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptchd3Q0EEE2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptchd3Q0EEE2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptchd3Q0EEE2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptchd3Q0EEE2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptchd3Q0EEE2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptchd3Q0EEE2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptchd3Q0EEE2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptchd3Q0EEE2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptchd3Q0EEE2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptchd3Q0EEE2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptchd3Q0EEE2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptchd3Q0EEE2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptchd3Q0EEE2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptchd3Q0EEE2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptchd3Q0EEE2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptchd3Q0EEE2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptchd3Q0EEE2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptchd3Q0EEE2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptchd3Q0EEE2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptchd3Q0EEE2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptchd3Q0EEE2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptchd3Q0EEE2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptchd3Q0EEE2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptchd3Q0EEE2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptchd3Q0EEE2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptchd3Q0EEE2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptchd3Q0EEE2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptchd3Q0EEE2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptchd3Q0EEE2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptchd3Q0EEE2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptchd3Q0EEE2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptchd3Q0EEE2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptchd3Q0EEE2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptchd3Q0EEE2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptchd3Q0EEE2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptchd3Q0EEE2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptchd3Q0EEE2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptchd3Q0EEE2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptchd3Q0EEE2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptchd3Q0EEE2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptchd3Q0EEE2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptchd3Q0EEE2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptchd3Q0EEE2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptchd3Q0EEE2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptchd3Q0EEE2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptchd3Q0EEE2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptchd3Q0EEE2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptchd3Q0EEE2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptchd3Q0EEE2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptchd3Q0EEE2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptchd3Q0EEE2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptchd3Q0EEE2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptchd3Q0EEE2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptchd3Q0EEE2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptchd3Q0EEE2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptchd3Q0EEE2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptchd3Q0EEE2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptchd3Q0EEE2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptchd3Q0EEE2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptchd3Q0EEE2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptchd3Q0EEE2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ptchd3Q0EEE2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ptchd3Q0EEE2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptchd3Q0EEE2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptchd3Q0EEE2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptchd3Q0EEE2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptchd3Q0EEE2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptchd3Q0EEE2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptchd3Q0EEE2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptchd3Q0EEE2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptchd3Q0EEE2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptchd3Q0EEE2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptchd3Q0EEE2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptchd3Q0EEE2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptchd3Q0EEE2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptchd3Q0EEE2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptchd3Q0EEE2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptchd3Q0EEE2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms