Protein–RNA interactions for Protein: Q08EJ0

Plac8l1, PLAC8-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plac8l1Q08EJ0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Plac8l1Q08EJ0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Plac8l1Q08EJ0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plac8l1Q08EJ0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plac8l1Q08EJ0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Plac8l1Q08EJ0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plac8l1Q08EJ0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plac8l1Q08EJ0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Plac8l1Q08EJ0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plac8l1Q08EJ0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plac8l1Q08EJ0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plac8l1Q08EJ0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plac8l1Q08EJ0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Plac8l1Q08EJ0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plac8l1Q08EJ0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Plac8l1Q08EJ0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plac8l1Q08EJ0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plac8l1Q08EJ0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plac8l1Q08EJ0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plac8l1Q08EJ0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plac8l1Q08EJ0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plac8l1Q08EJ0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plac8l1Q08EJ0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plac8l1Q08EJ0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plac8l1Q08EJ0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plac8l1Q08EJ0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plac8l1Q08EJ0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plac8l1Q08EJ0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plac8l1Q08EJ0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plac8l1Q08EJ0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plac8l1Q08EJ0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plac8l1Q08EJ0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plac8l1Q08EJ0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plac8l1Q08EJ0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plac8l1Q08EJ0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plac8l1Q08EJ0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plac8l1Q08EJ0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plac8l1Q08EJ0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plac8l1Q08EJ0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plac8l1Q08EJ0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plac8l1Q08EJ0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plac8l1Q08EJ0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plac8l1Q08EJ0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plac8l1Q08EJ0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plac8l1Q08EJ0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Plac8l1Q08EJ0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plac8l1Q08EJ0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Plac8l1Q08EJ0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plac8l1Q08EJ0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plac8l1Q08EJ0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plac8l1Q08EJ0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plac8l1Q08EJ0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plac8l1Q08EJ0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plac8l1Q08EJ0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plac8l1Q08EJ0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plac8l1Q08EJ0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plac8l1Q08EJ0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plac8l1Q08EJ0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plac8l1Q08EJ0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plac8l1Q08EJ0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Plac8l1Q08EJ0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plac8l1Q08EJ0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Plac8l1Q08EJ0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plac8l1Q08EJ0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plac8l1Q08EJ0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plac8l1Q08EJ0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plac8l1Q08EJ0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plac8l1Q08EJ0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plac8l1Q08EJ0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plac8l1Q08EJ0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plac8l1Q08EJ0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plac8l1Q08EJ0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plac8l1Q08EJ0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Plac8l1Q08EJ0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plac8l1Q08EJ0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plac8l1Q08EJ0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plac8l1Q08EJ0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plac8l1Q08EJ0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plac8l1Q08EJ0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plac8l1Q08EJ0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plac8l1Q08EJ0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plac8l1Q08EJ0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plac8l1Q08EJ0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plac8l1Q08EJ0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plac8l1Q08EJ0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Plac8l1Q08EJ0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Plac8l1Q08EJ0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Plac8l1Q08EJ0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plac8l1Q08EJ0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plac8l1Q08EJ0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Plac8l1Q08EJ0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plac8l1Q08EJ0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plac8l1Q08EJ0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plac8l1Q08EJ0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plac8l1Q08EJ0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plac8l1Q08EJ0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plac8l1Q08EJ0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plac8l1Q08EJ0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plac8l1Q08EJ0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plac8l1Q08EJ0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms