Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700061G19RikQ08EE8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700061G19RikQ08EE8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700061G19RikQ08EE8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700061G19RikQ08EE8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700061G19RikQ08EE8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700061G19RikQ08EE8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700061G19RikQ08EE8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700061G19RikQ08EE8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700061G19RikQ08EE8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700061G19RikQ08EE8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700061G19RikQ08EE8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700061G19RikQ08EE8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700061G19RikQ08EE8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700061G19RikQ08EE8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
1700061G19RikQ08EE8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
1700061G19RikQ08EE8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700061G19RikQ08EE8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700061G19RikQ08EE8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700061G19RikQ08EE8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700061G19RikQ08EE8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700061G19RikQ08EE8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700061G19RikQ08EE8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700061G19RikQ08EE8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700061G19RikQ08EE8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700061G19RikQ08EE8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700061G19RikQ08EE8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700061G19RikQ08EE8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700061G19RikQ08EE8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700061G19RikQ08EE8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700061G19RikQ08EE8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700061G19RikQ08EE8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700061G19RikQ08EE8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700061G19RikQ08EE8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700061G19RikQ08EE8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700061G19RikQ08EE8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
1700061G19RikQ08EE8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
1700061G19RikQ08EE8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
1700061G19RikQ08EE8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700061G19RikQ08EE8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700061G19RikQ08EE8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700061G19RikQ08EE8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700061G19RikQ08EE8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700061G19RikQ08EE8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700061G19RikQ08EE8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700061G19RikQ08EE8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700061G19RikQ08EE8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700061G19RikQ08EE8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700061G19RikQ08EE8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700061G19RikQ08EE8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700061G19RikQ08EE8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700061G19RikQ08EE8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700061G19RikQ08EE8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
1700061G19RikQ08EE8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700061G19RikQ08EE8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700061G19RikQ08EE8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
1700061G19RikQ08EE8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1700061G19RikQ08EE8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1700061G19RikQ08EE8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700061G19RikQ08EE8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700061G19RikQ08EE8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700061G19RikQ08EE8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700061G19RikQ08EE8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700061G19RikQ08EE8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700061G19RikQ08EE8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700061G19RikQ08EE8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700061G19RikQ08EE8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700061G19RikQ08EE8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
1700061G19RikQ08EE8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
1700061G19RikQ08EE8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
1700061G19RikQ08EE8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
1700061G19RikQ08EE8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
1700061G19RikQ08EE8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700061G19RikQ08EE8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700061G19RikQ08EE8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700061G19RikQ08EE8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700061G19RikQ08EE8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700061G19RikQ08EE8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700061G19RikQ08EE8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700061G19RikQ08EE8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700061G19RikQ08EE8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700061G19RikQ08EE8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700061G19RikQ08EE8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700061G19RikQ08EE8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700061G19RikQ08EE8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700061G19RikQ08EE8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700061G19RikQ08EE8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700061G19RikQ08EE8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700061G19RikQ08EE8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
1700061G19RikQ08EE8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700061G19RikQ08EE8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700061G19RikQ08EE8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700061G19RikQ08EE8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
1700061G19RikQ08EE8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
1700061G19RikQ08EE8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
1700061G19RikQ08EE8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms