Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk18Q04899 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk18Q04899 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk18Q04899 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk18Q04899 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk18Q04899 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdk18Q04899 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdk18Q04899 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdk18Q04899 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdk18Q04899 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk18Q04899 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk18Q04899 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk18Q04899 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk18Q04899 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk18Q04899 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk18Q04899 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk18Q04899 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk18Q04899 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk18Q04899 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk18Q04899 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdk18Q04899 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdk18Q04899 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdk18Q04899 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdk18Q04899 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk18Q04899 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk18Q04899 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk18Q04899 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk18Q04899 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk18Q04899 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk18Q04899 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk18Q04899 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk18Q04899 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk18Q04899 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk18Q04899 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk18Q04899 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk18Q04899 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cdk18Q04899 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cdk18Q04899 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk18Q04899 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk18Q04899 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk18Q04899 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk18Q04899 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk18Q04899 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk18Q04899 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk18Q04899 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk18Q04899 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk18Q04899 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk18Q04899 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk18Q04899 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk18Q04899 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk18Q04899 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk18Q04899 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk18Q04899 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk18Q04899 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk18Q04899 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk18Q04899 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk18Q04899 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk18Q04899 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk18Q04899 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk18Q04899 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk18Q04899 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk18Q04899 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk18Q04899 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk18Q04899 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk18Q04899 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk18Q04899 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk18Q04899 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk18Q04899 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk18Q04899 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk18Q04899 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk18Q04899 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk18Q04899 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk18Q04899 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk18Q04899 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk18Q04899 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdk18Q04899 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdk18Q04899 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk18Q04899 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk18Q04899 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk18Q04899 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk18Q04899 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk18Q04899 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk18Q04899 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk18Q04899 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk18Q04899 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk18Q04899 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk18Q04899 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk18Q04899 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk18Q04899 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk18Q04899 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdk18Q04899 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk18Q04899 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdk18Q04899 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk18Q04899 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk18Q04899 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk18Q04899 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk18Q04899 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk18Q04899 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk18Q04899 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk18Q04899 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms