Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kcnb1Q03717 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kcnb1Q03717 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kcnb1Q03717 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kcnb1Q03717 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kcnb1Q03717 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kcnb1Q03717 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kcnb1Q03717 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kcnb1Q03717 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kcnb1Q03717 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Kcnb1Q03717 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kcnb1Q03717 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kcnb1Q03717 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kcnb1Q03717 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kcnb1Q03717 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kcnb1Q03717 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kcnb1Q03717 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kcnb1Q03717 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kcnb1Q03717 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kcnb1Q03717 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kcnb1Q03717 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kcnb1Q03717 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kcnb1Q03717 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kcnb1Q03717 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kcnb1Q03717 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kcnb1Q03717 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Kcnb1Q03717 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kcnb1Q03717 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kcnb1Q03717 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kcnb1Q03717 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kcnb1Q03717 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kcnb1Q03717 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kcnb1Q03717 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kcnb1Q03717 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kcnb1Q03717 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kcnb1Q03717 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kcnb1Q03717 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kcnb1Q03717 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kcnb1Q03717 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Kcnb1Q03717 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kcnb1Q03717 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kcnb1Q03717 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kcnb1Q03717 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kcnb1Q03717 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kcnb1Q03717 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kcnb1Q03717 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kcnb1Q03717 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kcnb1Q03717 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kcnb1Q03717 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kcnb1Q03717 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kcnb1Q03717 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kcnb1Q03717 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kcnb1Q03717 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kcnb1Q03717 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kcnb1Q03717 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kcnb1Q03717 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Kcnb1Q03717 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kcnb1Q03717 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kcnb1Q03717 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kcnb1Q03717 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kcnb1Q03717 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kcnb1Q03717 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kcnb1Q03717 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kcnb1Q03717 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Kcnb1Q03717 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Kcnb1Q03717 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Kcnb1Q03717 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Kcnb1Q03717 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Kcnb1Q03717 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Kcnb1Q03717 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kcnb1Q03717 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kcnb1Q03717 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kcnb1Q03717 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kcnb1Q03717 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kcnb1Q03717 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Kcnb1Q03717 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Kcnb1Q03717 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kcnb1Q03717 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kcnb1Q03717 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kcnb1Q03717 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kcnb1Q03717 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kcnb1Q03717 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kcnb1Q03717 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kcnb1Q03717 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kcnb1Q03717 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kcnb1Q03717 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kcnb1Q03717 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kcnb1Q03717 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kcnb1Q03717 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kcnb1Q03717 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kcnb1Q03717 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kcnb1Q03717 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kcnb1Q03717 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kcnb1Q03717 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kcnb1Q03717 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kcnb1Q03717 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kcnb1Q03717 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kcnb1Q03717 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kcnb1Q03717 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kcnb1Q03717 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms