Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Scg2Q03517 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Scg2Q03517 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Scg2Q03517 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Scg2Q03517 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Scg2Q03517 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Scg2Q03517 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Scg2Q03517 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Scg2Q03517 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Scg2Q03517 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Scg2Q03517 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Scg2Q03517 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Scg2Q03517 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Scg2Q03517 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Scg2Q03517 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Scg2Q03517 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scg2Q03517 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scg2Q03517 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scg2Q03517 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scg2Q03517 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scg2Q03517 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scg2Q03517 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scg2Q03517 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scg2Q03517 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scg2Q03517 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scg2Q03517 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scg2Q03517 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scg2Q03517 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scg2Q03517 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scg2Q03517 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scg2Q03517 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scg2Q03517 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scg2Q03517 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Scg2Q03517 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scg2Q03517 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scg2Q03517 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scg2Q03517 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scg2Q03517 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scg2Q03517 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scg2Q03517 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Scg2Q03517 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Scg2Q03517 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Scg2Q03517 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Scg2Q03517 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Scg2Q03517 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Scg2Q03517 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Scg2Q03517 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Scg2Q03517 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Scg2Q03517 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Scg2Q03517 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Scg2Q03517 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Scg2Q03517 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Scg2Q03517 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Scg2Q03517 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Scg2Q03517 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Scg2Q03517 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Scg2Q03517 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Scg2Q03517 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Scg2Q03517 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scg2Q03517 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scg2Q03517 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scg2Q03517 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Scg2Q03517 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Scg2Q03517 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Scg2Q03517 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Scg2Q03517 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Scg2Q03517 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scg2Q03517 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scg2Q03517 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scg2Q03517 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Scg2Q03517 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Scg2Q03517 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Scg2Q03517 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Scg2Q03517 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Scg2Q03517 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Scg2Q03517 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Scg2Q03517 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Scg2Q03517 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Scg2Q03517 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Scg2Q03517 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Scg2Q03517 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Scg2Q03517 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Scg2Q03517 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Scg2Q03517 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Scg2Q03517 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Scg2Q03517 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Scg2Q03517 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Scg2Q03517 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Scg2Q03517 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Scg2Q03517 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Scg2Q03517 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
Scg2Q03517 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Scg2Q03517 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Scg2Q03517 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Scg2Q03517 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Scg2Q03517 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Scg2Q03517 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Scg2Q03517 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Scg2Q03517 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Scg2Q03517 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms