Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tff2Q03404 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tff2Q03404 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tff2Q03404 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tff2Q03404 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tff2Q03404 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tff2Q03404 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tff2Q03404 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tff2Q03404 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tff2Q03404 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tff2Q03404 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tff2Q03404 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tff2Q03404 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tff2Q03404 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tff2Q03404 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tff2Q03404 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tff2Q03404 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tff2Q03404 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tff2Q03404 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tff2Q03404 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tff2Q03404 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tff2Q03404 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tff2Q03404 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tff2Q03404 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tff2Q03404 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tff2Q03404 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tff2Q03404 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tff2Q03404 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tff2Q03404 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Tff2Q03404 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Tff2Q03404 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tff2Q03404 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tff2Q03404 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tff2Q03404 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tff2Q03404 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tff2Q03404 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tff2Q03404 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Tff2Q03404 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tff2Q03404 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tff2Q03404 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tff2Q03404 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tff2Q03404 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tff2Q03404 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tff2Q03404 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tff2Q03404 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tff2Q03404 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tff2Q03404 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tff2Q03404 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tff2Q03404 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tff2Q03404 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Tff2Q03404 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tff2Q03404 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tff2Q03404 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tff2Q03404 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tff2Q03404 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tff2Q03404 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tff2Q03404 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tff2Q03404 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tff2Q03404 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tff2Q03404 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tff2Q03404 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tff2Q03404 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tff2Q03404 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tff2Q03404 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Tff2Q03404 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tff2Q03404 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tff2Q03404 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tff2Q03404 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tff2Q03404 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Tff2Q03404 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tff2Q03404 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tff2Q03404 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tff2Q03404 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tff2Q03404 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tff2Q03404 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tff2Q03404 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tff2Q03404 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tff2Q03404 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tff2Q03404 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tff2Q03404 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tff2Q03404 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tff2Q03404 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tff2Q03404 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tff2Q03404 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tff2Q03404 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tff2Q03404 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tff2Q03404 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tff2Q03404 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tff2Q03404 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tff2Q03404 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tff2Q03404 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Tff2Q03404 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Tff2Q03404 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tff2Q03404 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tff2Q03404 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Tff2Q03404 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Tff2Q03404 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tff2Q03404 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tff2Q03404 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tff2Q03404 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms