Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msx2Q03358 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Msx2Q03358 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Msx2Q03358 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Msx2Q03358 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msx2Q03358 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msx2Q03358 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msx2Q03358 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msx2Q03358 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msx2Q03358 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msx2Q03358 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Msx2Q03358 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Msx2Q03358 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Msx2Q03358 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msx2Q03358 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msx2Q03358 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msx2Q03358 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Msx2Q03358 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Msx2Q03358 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Msx2Q03358 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Msx2Q03358 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Msx2Q03358 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Msx2Q03358 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Msx2Q03358 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Msx2Q03358 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Msx2Q03358 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Msx2Q03358 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Msx2Q03358 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Msx2Q03358 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Msx2Q03358 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Msx2Q03358 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Msx2Q03358 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Msx2Q03358 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Msx2Q03358 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Msx2Q03358 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Msx2Q03358 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Msx2Q03358 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Msx2Q03358 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msx2Q03358 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msx2Q03358 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msx2Q03358 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msx2Q03358 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msx2Q03358 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msx2Q03358 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msx2Q03358 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msx2Q03358 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msx2Q03358 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msx2Q03358 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msx2Q03358 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msx2Q03358 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msx2Q03358 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msx2Q03358 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msx2Q03358 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msx2Q03358 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msx2Q03358 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msx2Q03358 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msx2Q03358 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msx2Q03358 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Msx2Q03358 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Msx2Q03358 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Msx2Q03358 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msx2Q03358 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Msx2Q03358 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msx2Q03358 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msx2Q03358 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msx2Q03358 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msx2Q03358 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msx2Q03358 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msx2Q03358 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msx2Q03358 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msx2Q03358 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msx2Q03358 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msx2Q03358 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msx2Q03358 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msx2Q03358 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msx2Q03358 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msx2Q03358 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msx2Q03358 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msx2Q03358 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Msx2Q03358 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msx2Q03358 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msx2Q03358 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msx2Q03358 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msx2Q03358 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msx2Q03358 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msx2Q03358 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msx2Q03358 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msx2Q03358 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msx2Q03358 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msx2Q03358 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Msx2Q03358 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msx2Q03358 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msx2Q03358 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msx2Q03358 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msx2Q03358 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msx2Q03358 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msx2Q03358 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msx2Q03358 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msx2Q03358 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msx2Q03358 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms