Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Runx1Q03347 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Runx1Q03347 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Runx1Q03347 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Runx1Q03347 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Runx1Q03347 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Runx1Q03347 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Runx1Q03347 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Runx1Q03347 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Runx1Q03347 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Runx1Q03347 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Runx1Q03347 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Runx1Q03347 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Runx1Q03347 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Runx1Q03347 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Runx1Q03347 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Runx1Q03347 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Runx1Q03347 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Runx1Q03347 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Runx1Q03347 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Runx1Q03347 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Runx1Q03347 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Runx1Q03347 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Runx1Q03347 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Runx1Q03347 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Runx1Q03347 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Runx1Q03347 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Runx1Q03347 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Runx1Q03347 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Runx1Q03347 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Runx1Q03347 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Runx1Q03347 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Runx1Q03347 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Runx1Q03347 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Runx1Q03347 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Runx1Q03347 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Runx1Q03347 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Runx1Q03347 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Runx1Q03347 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Runx1Q03347 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Runx1Q03347 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Runx1Q03347 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Runx1Q03347 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Runx1Q03347 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Runx1Q03347 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Runx1Q03347 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Runx1Q03347 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Runx1Q03347 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Runx1Q03347 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Runx1Q03347 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Runx1Q03347 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Runx1Q03347 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Runx1Q03347 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Runx1Q03347 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Runx1Q03347 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Runx1Q03347 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Runx1Q03347 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Runx1Q03347 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Runx1Q03347 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Runx1Q03347 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Runx1Q03347 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Runx1Q03347 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Runx1Q03347 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Runx1Q03347 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Runx1Q03347 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Runx1Q03347 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Runx1Q03347 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Runx1Q03347 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Runx1Q03347 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Runx1Q03347 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Runx1Q03347 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Runx1Q03347 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Runx1Q03347 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Runx1Q03347 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Runx1Q03347 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Runx1Q03347 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Runx1Q03347 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Runx1Q03347 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Runx1Q03347 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Runx1Q03347 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Runx1Q03347 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Runx1Q03347 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Runx1Q03347 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Runx1Q03347 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Runx1Q03347 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Runx1Q03347 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Runx1Q03347 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Runx1Q03347 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Runx1Q03347 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Runx1Q03347 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Runx1Q03347 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Runx1Q03347 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Runx1Q03347 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Runx1Q03347 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Runx1Q03347 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Runx1Q03347 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Runx1Q03347 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Runx1Q03347 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Runx1Q03347 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Runx1Q03347 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms