Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GscQ02591 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GscQ02591 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GscQ02591 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GscQ02591 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GscQ02591 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GscQ02591 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GscQ02591 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GscQ02591 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GscQ02591 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GscQ02591 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GscQ02591 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GscQ02591 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GscQ02591 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GscQ02591 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GscQ02591 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GscQ02591 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GscQ02591 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GscQ02591 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GscQ02591 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GscQ02591 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GscQ02591 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GscQ02591 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GscQ02591 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GscQ02591 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
GscQ02591 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GscQ02591 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GscQ02591 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GscQ02591 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GscQ02591 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GscQ02591 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GscQ02591 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GscQ02591 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GscQ02591 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GscQ02591 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GscQ02591 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GscQ02591 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GscQ02591 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GscQ02591 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GscQ02591 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GscQ02591 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GscQ02591 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GscQ02591 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GscQ02591 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GscQ02591 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GscQ02591 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GscQ02591 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GscQ02591 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GscQ02591 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GscQ02591 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GscQ02591 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GscQ02591 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GscQ02591 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GscQ02591 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GscQ02591 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GscQ02591 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GscQ02591 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GscQ02591 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GscQ02591 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GscQ02591 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GscQ02591 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GscQ02591 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GscQ02591 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GscQ02591 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GscQ02591 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GscQ02591 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GscQ02591 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GscQ02591 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GscQ02591 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GscQ02591 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GscQ02591 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GscQ02591 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GscQ02591 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GscQ02591 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GscQ02591 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GscQ02591 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GscQ02591 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GscQ02591 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GscQ02591 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GscQ02591 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GscQ02591 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GscQ02591 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GscQ02591 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GscQ02591 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GscQ02591 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GscQ02591 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GscQ02591 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GscQ02591 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GscQ02591 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GscQ02591 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GscQ02591 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GscQ02591 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GscQ02591 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GscQ02591 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GscQ02591 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GscQ02591 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GscQ02591 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GscQ02591 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GscQ02591 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GscQ02591 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms