Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RykQ01887 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RykQ01887 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RykQ01887 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RykQ01887 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RykQ01887 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RykQ01887 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RykQ01887 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RykQ01887 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RykQ01887 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RykQ01887 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RykQ01887 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RykQ01887 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RykQ01887 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RykQ01887 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RykQ01887 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RykQ01887 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RykQ01887 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RykQ01887 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RykQ01887 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RykQ01887 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RykQ01887 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RykQ01887 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RykQ01887 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RykQ01887 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RykQ01887 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RykQ01887 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RykQ01887 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RykQ01887 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RykQ01887 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RykQ01887 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RykQ01887 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RykQ01887 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RykQ01887 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RykQ01887 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RykQ01887 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RykQ01887 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RykQ01887 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RykQ01887 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RykQ01887 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RykQ01887 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RykQ01887 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RykQ01887 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RykQ01887 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RykQ01887 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RykQ01887 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RykQ01887 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RykQ01887 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RykQ01887 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RykQ01887 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RykQ01887 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RykQ01887 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RykQ01887 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RykQ01887 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RykQ01887 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RykQ01887 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RykQ01887 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RykQ01887 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RykQ01887 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RykQ01887 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RykQ01887 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RykQ01887 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RykQ01887 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RykQ01887 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RykQ01887 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RykQ01887 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RykQ01887 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RykQ01887 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RykQ01887 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RykQ01887 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RykQ01887 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RykQ01887 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RykQ01887 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RykQ01887 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RykQ01887 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RykQ01887 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RykQ01887 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RykQ01887 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RykQ01887 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RykQ01887 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RykQ01887 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RykQ01887 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RykQ01887 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RykQ01887 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RykQ01887 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RykQ01887 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RykQ01887 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RykQ01887 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RykQ01887 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RykQ01887 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RykQ01887 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RykQ01887 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RykQ01887 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RykQ01887 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RykQ01887 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RykQ01887 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RykQ01887 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RykQ01887 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RykQ01887 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RykQ01887 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms