Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Top2aQ01320 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Top2aQ01320 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
Top2aQ01320 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC40■■■■□ 3.99
Top2aQ01320 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
Top2aQ01320 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Top2aQ01320 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Top2aQ01320 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Top2aQ01320 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC39.97■■■■□ 3.99
Top2aQ01320 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
Top2aQ01320 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Top2aQ01320 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
Top2aQ01320 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Top2aQ01320 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Top2aQ01320 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
Top2aQ01320 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
Top2aQ01320 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Top2aQ01320 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
Top2aQ01320 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Top2aQ01320 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Top2aQ01320 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
Top2aQ01320 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Top2aQ01320 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Top2aQ01320 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
Top2aQ01320 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Top2aQ01320 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Top2aQ01320 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Top2aQ01320 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Top2aQ01320 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Top2aQ01320 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Top2aQ01320 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Top2aQ01320 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
Top2aQ01320 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
Top2aQ01320 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Top2aQ01320 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Top2aQ01320 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Top2aQ01320 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Top2aQ01320 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Top2aQ01320 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
Top2aQ01320 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
Top2aQ01320 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
Top2aQ01320 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Top2aQ01320 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Top2aQ01320 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Top2aQ01320 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Top2aQ01320 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Top2aQ01320 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
Top2aQ01320 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Top2aQ01320 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
Top2aQ01320 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Top2aQ01320 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Top2aQ01320 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
Top2aQ01320 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
Top2aQ01320 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Top2aQ01320 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Top2aQ01320 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Top2aQ01320 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Top2aQ01320 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Top2aQ01320 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Top2aQ01320 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
Top2aQ01320 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
Top2aQ01320 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Top2aQ01320 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC39.61■■■■□ 3.93
Top2aQ01320 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Top2aQ01320 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Top2aQ01320 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
Top2aQ01320 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Top2aQ01320 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
Top2aQ01320 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Top2aQ01320 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.93
Top2aQ01320 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Top2aQ01320 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Top2aQ01320 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Top2aQ01320 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Top2aQ01320 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Top2aQ01320 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
Top2aQ01320 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
Top2aQ01320 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Top2aQ01320 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
Top2aQ01320 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Top2aQ01320 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
Top2aQ01320 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Top2aQ01320 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC39.45■■■■□ 3.91
Top2aQ01320 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
Top2aQ01320 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
Top2aQ01320 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Top2aQ01320 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
Top2aQ01320 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Top2aQ01320 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Top2aQ01320 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Top2aQ01320 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Top2aQ01320 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Top2aQ01320 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
Top2aQ01320 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Top2aQ01320 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Top2aQ01320 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Top2aQ01320 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Top2aQ01320 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Top2aQ01320 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Top2aQ01320 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms