Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Grin2cQ01098 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Grin2cQ01098 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Grin2cQ01098 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Grin2cQ01098 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Grin2cQ01098 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Grin2cQ01098 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Grin2cQ01098 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Grin2cQ01098 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Grin2cQ01098 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Grin2cQ01098 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Grin2cQ01098 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Grin2cQ01098 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Grin2cQ01098 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Grin2cQ01098 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Grin2cQ01098 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Grin2cQ01098 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Grin2cQ01098 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Grin2cQ01098 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Grin2cQ01098 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grin2cQ01098 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grin2cQ01098 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Grin2cQ01098 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grin2cQ01098 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grin2cQ01098 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grin2cQ01098 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2cQ01098 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2cQ01098 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2cQ01098 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grin2cQ01098 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grin2cQ01098 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grin2cQ01098 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grin2cQ01098 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grin2cQ01098 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Grin2cQ01098 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grin2cQ01098 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grin2cQ01098 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2cQ01098 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2cQ01098 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2cQ01098 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2cQ01098 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2cQ01098 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2cQ01098 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Grin2cQ01098 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2cQ01098 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2cQ01098 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2cQ01098 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grin2cQ01098 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grin2cQ01098 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grin2cQ01098 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grin2cQ01098 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grin2cQ01098 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grin2cQ01098 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Grin2cQ01098 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grin2cQ01098 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grin2cQ01098 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2cQ01098 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2cQ01098 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grin2cQ01098 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grin2cQ01098 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grin2cQ01098 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Grin2cQ01098 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Grin2cQ01098 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grin2cQ01098 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grin2cQ01098 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Grin2cQ01098 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Grin2cQ01098 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Grin2cQ01098 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Grin2cQ01098 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Grin2cQ01098 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Grin2cQ01098 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Grin2cQ01098 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Grin2cQ01098 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Grin2cQ01098 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Grin2cQ01098 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Grin2cQ01098 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grin2cQ01098 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grin2cQ01098 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grin2cQ01098 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grin2cQ01098 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grin2cQ01098 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grin2cQ01098 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grin2cQ01098 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Grin2cQ01098 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Grin2cQ01098 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Grin2cQ01098 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Grin2cQ01098 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Grin2cQ01098 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Grin2cQ01098 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grin2cQ01098 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grin2cQ01098 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grin2cQ01098 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grin2cQ01098 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grin2cQ01098 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grin2cQ01098 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grin2cQ01098 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grin2cQ01098 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grin2cQ01098 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Grin2cQ01098 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grin2cQ01098 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms