Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp4Q00724 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbp4Q00724 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbp4Q00724 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbp4Q00724 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbp4Q00724 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbp4Q00724 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbp4Q00724 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbp4Q00724 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbp4Q00724 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbp4Q00724 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbp4Q00724 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbp4Q00724 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbp4Q00724 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbp4Q00724 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbp4Q00724 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbp4Q00724 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbp4Q00724 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbp4Q00724 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbp4Q00724 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbp4Q00724 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbp4Q00724 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbp4Q00724 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbp4Q00724 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbp4Q00724 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbp4Q00724 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbp4Q00724 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbp4Q00724 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbp4Q00724 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbp4Q00724 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbp4Q00724 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbp4Q00724 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbp4Q00724 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbp4Q00724 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbp4Q00724 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbp4Q00724 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbp4Q00724 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbp4Q00724 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbp4Q00724 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbp4Q00724 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbp4Q00724 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbp4Q00724 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbp4Q00724 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbp4Q00724 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbp4Q00724 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbp4Q00724 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbp4Q00724 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbp4Q00724 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbp4Q00724 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbp4Q00724 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbp4Q00724 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbp4Q00724 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbp4Q00724 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbp4Q00724 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbp4Q00724 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbp4Q00724 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbp4Q00724 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbp4Q00724 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbp4Q00724 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rbp4Q00724 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rbp4Q00724 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbp4Q00724 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbp4Q00724 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbp4Q00724 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbp4Q00724 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbp4Q00724 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbp4Q00724 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbp4Q00724 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbp4Q00724 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbp4Q00724 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbp4Q00724 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbp4Q00724 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbp4Q00724 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbp4Q00724 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbp4Q00724 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbp4Q00724 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbp4Q00724 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbp4Q00724 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbp4Q00724 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbp4Q00724 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbp4Q00724 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbp4Q00724 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbp4Q00724 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbp4Q00724 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbp4Q00724 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbp4Q00724 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbp4Q00724 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbp4Q00724 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbp4Q00724 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbp4Q00724 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbp4Q00724 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbp4Q00724 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbp4Q00724 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbp4Q00724 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbp4Q00724 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbp4Q00724 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbp4Q00724 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbp4Q00724 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbp4Q00724 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rbp4Q00724 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms