Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Il6stQ00560 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Il6stQ00560 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Il6stQ00560 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Il6stQ00560 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
Il6stQ00560 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Il6stQ00560 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Il6stQ00560 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Il6stQ00560 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Il6stQ00560 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Il6stQ00560 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Il6stQ00560 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Il6stQ00560 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Il6stQ00560 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Il6stQ00560 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Il6stQ00560 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Il6stQ00560 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Il6stQ00560 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Il6stQ00560 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Il6stQ00560 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Il6stQ00560 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Il6stQ00560 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Il6stQ00560 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Il6stQ00560 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Il6stQ00560 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Il6stQ00560 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Il6stQ00560 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Il6stQ00560 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Il6stQ00560 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Il6stQ00560 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Il6stQ00560 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Il6stQ00560 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Il6stQ00560 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Il6stQ00560 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Il6stQ00560 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Il6stQ00560 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Il6stQ00560 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Il6stQ00560 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Il6stQ00560 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Il6stQ00560 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Il6stQ00560 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Il6stQ00560 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Il6stQ00560 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Il6stQ00560 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Il6stQ00560 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Il6stQ00560 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Il6stQ00560 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Il6stQ00560 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Il6stQ00560 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Il6stQ00560 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Il6stQ00560 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Il6stQ00560 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Il6stQ00560 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Il6stQ00560 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Il6stQ00560 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Il6stQ00560 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Il6stQ00560 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Il6stQ00560 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Il6stQ00560 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Il6stQ00560 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Il6stQ00560 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Il6stQ00560 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Il6stQ00560 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Il6stQ00560 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Il6stQ00560 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Il6stQ00560 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Il6stQ00560 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Il6stQ00560 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Il6stQ00560 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Il6stQ00560 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Il6stQ00560 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Il6stQ00560 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Il6stQ00560 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Il6stQ00560 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Il6stQ00560 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Il6stQ00560 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Il6stQ00560 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Il6stQ00560 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Il6stQ00560 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Il6stQ00560 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Il6stQ00560 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Il6stQ00560 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Il6stQ00560 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Il6stQ00560 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Il6stQ00560 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Il6stQ00560 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Il6stQ00560 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Il6stQ00560 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Il6stQ00560 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Il6stQ00560 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Il6stQ00560 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Il6stQ00560 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Il6stQ00560 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Il6stQ00560 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Il6stQ00560 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Il6stQ00560 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Il6stQ00560 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Il6stQ00560 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Il6stQ00560 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Il6stQ00560 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms