Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pou1f1Q00286 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pou1f1Q00286 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pou1f1Q00286 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pou1f1Q00286 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou1f1Q00286 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou1f1Q00286 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou1f1Q00286 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pou1f1Q00286 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou1f1Q00286 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou1f1Q00286 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou1f1Q00286 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou1f1Q00286 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou1f1Q00286 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou1f1Q00286 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pou1f1Q00286 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pou1f1Q00286 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pou1f1Q00286 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pou1f1Q00286 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pou1f1Q00286 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pou1f1Q00286 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pou1f1Q00286 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pou1f1Q00286 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pou1f1Q00286 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pou1f1Q00286 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pou1f1Q00286 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pou1f1Q00286 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pou1f1Q00286 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pou1f1Q00286 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pou1f1Q00286 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pou1f1Q00286 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pou1f1Q00286 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pou1f1Q00286 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pou1f1Q00286 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pou1f1Q00286 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou1f1Q00286 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou1f1Q00286 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou1f1Q00286 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou1f1Q00286 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou1f1Q00286 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou1f1Q00286 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou1f1Q00286 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pou1f1Q00286 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pou1f1Q00286 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pou1f1Q00286 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pou1f1Q00286 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pou1f1Q00286 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pou1f1Q00286 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pou1f1Q00286 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pou1f1Q00286 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pou1f1Q00286 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pou1f1Q00286 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pou1f1Q00286 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pou1f1Q00286 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pou1f1Q00286 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Pou1f1Q00286 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pou1f1Q00286 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pou1f1Q00286 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pou1f1Q00286 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pou1f1Q00286 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pou1f1Q00286 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pou1f1Q00286 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pou1f1Q00286 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pou1f1Q00286 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pou1f1Q00286 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pou1f1Q00286 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pou1f1Q00286 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pou1f1Q00286 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pou1f1Q00286 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pou1f1Q00286 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pou1f1Q00286 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pou1f1Q00286 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pou1f1Q00286 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pou1f1Q00286 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pou1f1Q00286 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pou1f1Q00286 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pou1f1Q00286 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pou1f1Q00286 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pou1f1Q00286 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pou1f1Q00286 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pou1f1Q00286 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pou1f1Q00286 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou1f1Q00286 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou1f1Q00286 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou1f1Q00286 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pou1f1Q00286 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pou1f1Q00286 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pou1f1Q00286 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pou1f1Q00286 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pou1f1Q00286 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pou1f1Q00286 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pou1f1Q00286 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pou1f1Q00286 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pou1f1Q00286 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pou1f1Q00286 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pou1f1Q00286 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pou1f1Q00286 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pou1f1Q00286 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pou1f1Q00286 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pou1f1Q00286 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms