Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VldlrP98156 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VldlrP98156 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VldlrP98156 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VldlrP98156 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VldlrP98156 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VldlrP98156 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VldlrP98156 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VldlrP98156 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VldlrP98156 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VldlrP98156 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VldlrP98156 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VldlrP98156 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VldlrP98156 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VldlrP98156 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VldlrP98156 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VldlrP98156 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VldlrP98156 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VldlrP98156 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VldlrP98156 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VldlrP98156 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VldlrP98156 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VldlrP98156 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VldlrP98156 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VldlrP98156 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VldlrP98156 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VldlrP98156 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VldlrP98156 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VldlrP98156 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VldlrP98156 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VldlrP98156 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VldlrP98156 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VldlrP98156 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VldlrP98156 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VldlrP98156 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VldlrP98156 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VldlrP98156 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VldlrP98156 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VldlrP98156 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VldlrP98156 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VldlrP98156 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VldlrP98156 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VldlrP98156 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VldlrP98156 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VldlrP98156 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VldlrP98156 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VldlrP98156 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VldlrP98156 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VldlrP98156 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VldlrP98156 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VldlrP98156 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VldlrP98156 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VldlrP98156 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VldlrP98156 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VldlrP98156 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VldlrP98156 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VldlrP98156 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VldlrP98156 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VldlrP98156 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VldlrP98156 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VldlrP98156 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VldlrP98156 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VldlrP98156 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VldlrP98156 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VldlrP98156 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VldlrP98156 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VldlrP98156 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VldlrP98156 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VldlrP98156 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VldlrP98156 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VldlrP98156 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VldlrP98156 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VldlrP98156 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VldlrP98156 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VldlrP98156 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VldlrP98156 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VldlrP98156 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VldlrP98156 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VldlrP98156 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VldlrP98156 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VldlrP98156 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VldlrP98156 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VldlrP98156 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VldlrP98156 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
VldlrP98156 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VldlrP98156 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VldlrP98156 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VldlrP98156 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VldlrP98156 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VldlrP98156 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VldlrP98156 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VldlrP98156 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VldlrP98156 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VldlrP98156 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VldlrP98156 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VldlrP98156 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VldlrP98156 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VldlrP98156 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VldlrP98156 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VldlrP98156 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms