Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pitx2P97474 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pitx2P97474 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pitx2P97474 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pitx2P97474 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pitx2P97474 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pitx2P97474 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pitx2P97474 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pitx2P97474 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pitx2P97474 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pitx2P97474 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pitx2P97474 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pitx2P97474 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pitx2P97474 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pitx2P97474 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pitx2P97474 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pitx2P97474 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pitx2P97474 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pitx2P97474 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pitx2P97474 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pitx2P97474 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pitx2P97474 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pitx2P97474 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pitx2P97474 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pitx2P97474 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pitx2P97474 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pitx2P97474 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pitx2P97474 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Pitx2P97474 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pitx2P97474 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pitx2P97474 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pitx2P97474 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pitx2P97474 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pitx2P97474 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pitx2P97474 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pitx2P97474 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pitx2P97474 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pitx2P97474 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pitx2P97474 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pitx2P97474 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pitx2P97474 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pitx2P97474 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pitx2P97474 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pitx2P97474 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pitx2P97474 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pitx2P97474 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pitx2P97474 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pitx2P97474 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pitx2P97474 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pitx2P97474 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pitx2P97474 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pitx2P97474 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pitx2P97474 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pitx2P97474 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pitx2P97474 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pitx2P97474 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pitx2P97474 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pitx2P97474 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pitx2P97474 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pitx2P97474 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pitx2P97474 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pitx2P97474 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pitx2P97474 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pitx2P97474 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pitx2P97474 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pitx2P97474 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pitx2P97474 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pitx2P97474 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pitx2P97474 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pitx2P97474 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pitx2P97474 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pitx2P97474 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pitx2P97474 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pitx2P97474 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pitx2P97474 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pitx2P97474 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pitx2P97474 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pitx2P97474 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pitx2P97474 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pitx2P97474 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pitx2P97474 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pitx2P97474 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pitx2P97474 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pitx2P97474 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pitx2P97474 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pitx2P97474 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pitx2P97474 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pitx2P97474 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pitx2P97474 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pitx2P97474 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pitx2P97474 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pitx2P97474 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pitx2P97474 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pitx2P97474 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pitx2P97474 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pitx2P97474 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pitx2P97474 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pitx2P97474 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pitx2P97474 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pitx2P97474 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms