Protein–RNA interactions for Protein: P97357

Taf1a, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1aP97357 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf1aP97357 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf1aP97357 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf1aP97357 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf1aP97357 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf1aP97357 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf1aP97357 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Taf1aP97357 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Taf1aP97357 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf1aP97357 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Taf1aP97357 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Taf1aP97357 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Taf1aP97357 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Taf1aP97357 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Taf1aP97357 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Taf1aP97357 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Taf1aP97357 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf1aP97357 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf1aP97357 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Taf1aP97357 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Taf1aP97357 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Taf1aP97357 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Taf1aP97357 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf1aP97357 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf1aP97357 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf1aP97357 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf1aP97357 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf1aP97357 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Taf1aP97357 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf1aP97357 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Taf1aP97357 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf1aP97357 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf1aP97357 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf1aP97357 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Taf1aP97357 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1aP97357 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1aP97357 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1aP97357 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1aP97357 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1aP97357 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1aP97357 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Taf1aP97357 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Taf1aP97357 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf1aP97357 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf1aP97357 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf1aP97357 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf1aP97357 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Taf1aP97357 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Taf1aP97357 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Taf1aP97357 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Taf1aP97357 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Taf1aP97357 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Taf1aP97357 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Taf1aP97357 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Taf1aP97357 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Taf1aP97357 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Taf1aP97357 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf1aP97357 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Taf1aP97357 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Taf1aP97357 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Taf1aP97357 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Taf1aP97357 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Taf1aP97357 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Taf1aP97357 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Taf1aP97357 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Taf1aP97357 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Taf1aP97357 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Taf1aP97357 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Taf1aP97357 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Taf1aP97357 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Taf1aP97357 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Taf1aP97357 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Taf1aP97357 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Taf1aP97357 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Taf1aP97357 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Taf1aP97357 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Taf1aP97357 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Taf1aP97357 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Taf1aP97357 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Taf1aP97357 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Taf1aP97357 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Taf1aP97357 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Taf1aP97357 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Taf1aP97357 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf1aP97357 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf1aP97357 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf1aP97357 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf1aP97357 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Taf1aP97357 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Taf1aP97357 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf1aP97357 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf1aP97357 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf1aP97357 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1aP97357 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1aP97357 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1aP97357 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf1aP97357 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf1aP97357 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf1aP97357 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf1aP97357 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms