Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mesp1P97309 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mesp1P97309 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mesp1P97309 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Mesp1P97309 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mesp1P97309 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mesp1P97309 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mesp1P97309 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mesp1P97309 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mesp1P97309 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mesp1P97309 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mesp1P97309 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mesp1P97309 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mesp1P97309 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mesp1P97309 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mesp1P97309 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mesp1P97309 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mesp1P97309 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mesp1P97309 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mesp1P97309 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mesp1P97309 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Mesp1P97309 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Mesp1P97309 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mesp1P97309 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mesp1P97309 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mesp1P97309 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Mesp1P97309 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mesp1P97309 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Mesp1P97309 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mesp1P97309 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mesp1P97309 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mesp1P97309 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mesp1P97309 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mesp1P97309 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mesp1P97309 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mesp1P97309 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mesp1P97309 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mesp1P97309 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mesp1P97309 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mesp1P97309 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mesp1P97309 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mesp1P97309 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mesp1P97309 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mesp1P97309 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mesp1P97309 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mesp1P97309 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mesp1P97309 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mesp1P97309 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mesp1P97309 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mesp1P97309 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mesp1P97309 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mesp1P97309 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mesp1P97309 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mesp1P97309 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mesp1P97309 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mesp1P97309 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mesp1P97309 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mesp1P97309 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mesp1P97309 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mesp1P97309 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mesp1P97309 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mesp1P97309 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mesp1P97309 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mesp1P97309 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mesp1P97309 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mesp1P97309 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mesp1P97309 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mesp1P97309 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mesp1P97309 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mesp1P97309 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mesp1P97309 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mesp1P97309 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mesp1P97309 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mesp1P97309 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mesp1P97309 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mesp1P97309 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mesp1P97309 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mesp1P97309 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mesp1P97309 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mesp1P97309 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mesp1P97309 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mesp1P97309 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mesp1P97309 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Mesp1P97309 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mesp1P97309 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mesp1P97309 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mesp1P97309 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mesp1P97309 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mesp1P97309 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mesp1P97309 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mesp1P97309 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mesp1P97309 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mesp1P97309 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mesp1P97309 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mesp1P97309 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mesp1P97309 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mesp1P97309 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mesp1P97309 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mesp1P97309 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mesp1P97309 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms