Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Nucb2P81117 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nucb2P81117 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nucb2P81117 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nucb2P81117 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nucb2P81117 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Nucb2P81117 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nucb2P81117 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nucb2P81117 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nucb2P81117 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nucb2P81117 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nucb2P81117 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nucb2P81117 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nucb2P81117 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nucb2P81117 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nucb2P81117 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nucb2P81117 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nucb2P81117 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nucb2P81117 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nucb2P81117 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nucb2P81117 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nucb2P81117 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nucb2P81117 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nucb2P81117 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Nucb2P81117 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nucb2P81117 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nucb2P81117 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nucb2P81117 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nucb2P81117 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nucb2P81117 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nucb2P81117 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nucb2P81117 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nucb2P81117 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nucb2P81117 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nucb2P81117 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nucb2P81117 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nucb2P81117 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nucb2P81117 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nucb2P81117 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nucb2P81117 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Nucb2P81117 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nucb2P81117 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nucb2P81117 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nucb2P81117 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nucb2P81117 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nucb2P81117 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nucb2P81117 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nucb2P81117 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nucb2P81117 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nucb2P81117 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nucb2P81117 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nucb2P81117 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nucb2P81117 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nucb2P81117 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nucb2P81117 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nucb2P81117 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nucb2P81117 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nucb2P81117 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nucb2P81117 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nucb2P81117 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nucb2P81117 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nucb2P81117 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nucb2P81117 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nucb2P81117 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nucb2P81117 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nucb2P81117 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nucb2P81117 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nucb2P81117 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nucb2P81117 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nucb2P81117 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nucb2P81117 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nucb2P81117 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nucb2P81117 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nucb2P81117 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nucb2P81117 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nucb2P81117 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nucb2P81117 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nucb2P81117 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nucb2P81117 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nucb2P81117 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nucb2P81117 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nucb2P81117 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nucb2P81117 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nucb2P81117 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nucb2P81117 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nucb2P81117 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nucb2P81117 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nucb2P81117 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nucb2P81117 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nucb2P81117 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nucb2P81117 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nucb2P81117 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nucb2P81117 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nucb2P81117 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nucb2P81117 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nucb2P81117 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nucb2P81117 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nucb2P81117 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nucb2P81117 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nucb2P81117 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms